RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288616.7

CABP1-201, Transcript of calcium binding protein 1, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CABP1, Length 1,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1-201ENST00000288616 VPS37DQ86XT2 251 aa22.29■■□□□ 1.16
CABP1-201ENST00000288616 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.29■■□□□ 1.16
CABP1-201ENST00000288616 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.29■■□□□ 1.16
CABP1-201ENST00000288616 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.29■■□□□ 1.16
CABP1-201ENST00000288616 OTOFQ9HC10 1997 aa22.29■■□□□ 1.16
CABP1-201ENST00000288616 POTEFA5A3E0 1075 aa22.28■■□□□ 1.16
CABP1-201ENST00000288616 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CABP1-201ENST00000288616 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.28■■□□□ 1.16
CABP1-201ENST00000288616 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CABP1-201ENST00000288616 LRRC24Q50LG9 513 aa22.27■■□□□ 1.16
CABP1-201ENST00000288616 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CABP1-201ENST00000288616 TEPSINQ96N21 525 aa22.27■■□□□ 1.16
CABP1-201ENST00000288616 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CABP1-201ENST00000288616 EFCC1Q9HA90 598 aa22.27■■□□□ 1.16
CABP1-201ENST00000288616 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.27■■□□□ 1.16
CABP1-201ENST00000288616 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 TNNI2P48788 182 aa22.26■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 CACNB3P54284 484 aa22.26■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 SP3Q02447 781 aa22.26■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 METTL24Q5JXM2 366 aa22.26■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.26■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 LAMB1P07942 1786 aa22.26■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 MAP3K9P80192 1104 aa22.25■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 CAP1Q01518 475 aa22.25■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.25■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.25■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 VGLL4Q14135 290 aa22.25■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.25■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.25■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.24■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 CCL15Q16663 113 aa22.24■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.24■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 OTUD5Q96G74 571 aa22.24■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 CSADQ9Y600 493 aa22.24■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.23■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 BCAMP50895 628 aa22.23■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.23■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 UTYO14607 1347 aa22.22■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 GTF2A2P52657 109 aa22.22■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 TEKT1Q969V4 418 aa22.22■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 PDE8BO95263 885 aa22.21■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.21■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.21■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.21■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 HTTP42858 3142 aa22.21■■□□□ 1.15
CABP1-201ENST00000288616 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.19■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.18■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 ARMC5Q96C12 935 aa22.18■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 WRNIP1Q96S55 665 aa22.18■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.18■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 CENPFP49454 3210 aa22.17■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.17■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.17■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.17■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.16■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 USP44Q9H0E7 712 aa22.16■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 ARHGEF6Q15052 776 aa22.15■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.15■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 ERO1BQ86YB8 467 aa22.15■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 CETPP11597 493 aa22.14■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.14■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.14■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 GCC1Q96CN9 775 aa22.14■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.14■■□□□ 1.14
CABP1-201ENST00000288616 MAST3O60307 1309 aa22.14■■□□□ 1.13
CABP1-201ENST00000288616 PTPRCP08575 1304 aa22.14■■□□□ 1.13
CABP1-201ENST00000288616 ZNF521Q96K83 1311 aa22.14■■□□□ 1.13
CABP1-201ENST00000288616 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CABP1-201ENST00000288616 BTBD19C9JJ37 291 aa22.13■■□□□ 1.13
CABP1-201ENST00000288616 IRF6O14896 467 aa22.13■■□□□ 1.13
CABP1-201ENST00000288616 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CABP1-201ENST00000288616 FGFR2P21802 821 aa22.13■■□□□ 1.13
CABP1-201ENST00000288616 FAM83AQ86UY5 434 aa22.13■■□□□ 1.13
CABP1-201ENST00000288616 ZNF333Q96JL9 665 aa22.13■■□□□ 1.13
CABP1-201ENST00000288616 MRIQ9BWK5 157 aa22.13■■□□□ 1.13
CABP1-201ENST00000288616 AK9Q5TCS8 1911 aa22.13■■□□□ 1.13
CABP1-201ENST00000288616 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CABP1-201ENST00000288616 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.12■■□□□ 1.13
CABP1-201ENST00000288616 NBPF11Q86T75 865 aa22.12■■□□□ 1.13
CABP1-201ENST00000288616 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.12■■□□□ 1.13
CABP1-201ENST00000288616 EYA2O00167 538 aa22.12■■□□□ 1.13
CABP1-201ENST00000288616 TLR2O60603 784 aa22.12■■□□□ 1.13
CABP1-201ENST00000288616 SLC5A1P13866 664 aa22.12■■□□□ 1.13
CABP1-201ENST00000288616 TCP10Q12799 353 aa22.12■■□□□ 1.13
CABP1-201ENST00000288616 SNAPC2Q13487 334 aa22.12■■□□□ 1.13
CABP1-201ENST00000288616 KIF22Q14807 665 aa22.12■■□□□ 1.13
CABP1-201ENST00000288616 DCAF15Q66K64 600 aa22.12■■□□□ 1.13
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