RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 TSPY8P0CW00 308 aa10.38□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 INPP1P49441 399 aa10.38□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 PPFIA1Q13136 1202 aa10.38□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 CFTRP13569 1480 aa10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 SPOPO43791 374 aa10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 RARSP54136 660 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 CNNM2Q9H8M5 875 aa10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 TMOD3Q9NYL9 352 aa10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 GSTO1P78417 241 aa10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 AP1ARQ63HQ0 302 aa10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 TCHHQ07283 1943 aa10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 KRT5P13647 590 aa10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 RUFY4Q6ZNE9 571 aa10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 VSIG1Q86XK7 387 aa10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 FAM204AQ9H8W3 233 aa10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 HHATQ5VTY9 493 aa10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 CCDC89Q8N998 374 aa10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 STK38LQ9Y2H1 464 aa10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 MICAL3Q7RTP6 2002 aa10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 WDR46O15213 610 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 TIAM1Q13009 1591 aa10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 PFDN1O60925 122 aa10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 NUMA1Q14980 2115 aa10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 CFAP70Q5T0N1 1121 aa10.37□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 NAPAP54920 295 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 GABPAQ06546 454 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 NOX5Q96PH1 765 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 EFCAB5A4FU69 1503 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 SPTLC2O15270 562 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 TMX3Q96JJ7 454 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 HAUS8Q9BT25 410 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 KRT2P35908 639 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 SESN3P58005 492 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 TSHZ3Q63HK5 1081 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 DHX58Q96C10 678 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 FAM212AQ96EL1 285 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 CROCCP2Q86T23 111 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 DACT1Q9NYF0 836 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 STX8Q9UNK0 236 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 C20orf194Q5TEA3 1177 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 RASEFQ8IZ41 740 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 PPP4R1Q8TF05 950 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 TRIM75PA6NK02 468 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 HS2ST1Q7LGA3 356 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 NCAPD3P42695 1498 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 TRIM14Q14142 442 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 TAF12Q16514 161 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 CADPSQ9ULU8 1353 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 F13A1P00488 732 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 RAPGEF1Q13905 1077 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 CYP26C1Q6V0L0 522 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 SIRT1Q96EB6 747 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 CABP5Q9NP86 173 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 MTMR3Q13615 1198 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 STX10O60499 249 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 VWA3BQ502W6 1294 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 THEGQ9P2T0 379 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 CALML3P27482 149 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 TXNDC2Q86VQ3 553 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 ATP2A3Q93084 1043 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 EPB41P11171 864 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 BANK1Q8NDB2 785 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 ESR2Q92731 530 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 ELF2Q15723 593 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 NECAB1Q8N987 351 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 KIF14Q15058 1648 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 TRIM27P14373 513 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP10.35□□□□□ -0.758e-6■■■■□ 25
TNS1-201ENST00000171887 LCA5Q86VQ0 697 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 TMTC2Q8N394 836 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 SLC8A1P32418 973 aa10.34□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
TNS1-201ENST00000171887 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms