RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027592.5

Ubxn4-201, Transcript of UBX domain-containing protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubxn4, Length 4,113 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 2310002L09RikQ9D7L5 217 aa15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Zhx1P70121 873 aa15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 LarsQ8BMJ2 1178 aa15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gtf3c5Q8R2T8 520 aa15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Yeats4Q9CR11 227 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ttc14Q9CSP9 761 aa15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dydc1Q9D9T0 175 aa15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 GnaqP21279 359 aa15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 SsbP32067 415 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ppm1eQ80TL0 749 aa15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ttc27Q8CD92 847 aa15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Q9D5Q8 446 aa15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Naa16Q9DBB4 864 aa15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm42641I6L9G2 585 aa15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Calm1P0DP26 149 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Calm2P0DP27 149 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Calm3P0DP28 149 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cyp24a1Q64441 514 aa15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 AtripQ8BMG1 785 aa15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rbm43Q99J64 343 aa15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cdca7Q9D0M2 382 aa15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dydc2Q9D3X8 139 aa15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 U2af2P26369 475 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cdcp1Q5U462 833 aa15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 RgmbQ7TQ33 436 aa15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Frat2Q8K025 231 aa15.75■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Mdh1bQ5F204 500 aa15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 CtcfQ61164 736 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tfcp2Q9ERA0 502 aa15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Elf2Q9JHC9 593 aa15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Mrvi1Q9WUX5 899 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Clip2Q9Z0H8 1047 aa15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccdc121E9Q6D3 323 aa15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Atp2b1G5E829 1220 aa15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Hs2st1Q8R3H7 356 aa15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ginm1Q91WR6 327 aa15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Foxo3Q9WVH4 672 aa15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nfxl1E9Q8I7 918 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 NpcdF8VQB8 469 aa15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Atad2Q8CDM1 1040 aa15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ubac1Q8VDI7 409 aa15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 StrbpQ91WM1 672 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Egfl6Q9JJZ5 550 aa15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Abcc12Q80WJ6 1366 aa15.74■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cep170bQ80U49 1574 aa15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm20425E9Q035 978 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cyp26a1O55127 497 aa15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dync1i1O88485 628 aa15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Prl3d1P18121 224 aa15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 SrprbP47758 269 aa15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pfkfb1P70266 471 aa15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ankrd13dQ6PD24 605 aa15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Erlin2Q8BFZ9 340 aa15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Mipol1Q9D9F8 279 aa15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ppfibp1Q8C8U0 969 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nrbp1Q99J45 535 aa15.73■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Bmp2kQ91Z96 1138 aa15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 CemipQ8BI06 1361 aa15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm30191A0A0U1RNT7 187 aa15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dph6Q9CQ28 267 aa15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nol7Q9D7Z3 254 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Prr29B1ARI9 187 aa15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Fam186bD3Z420 943 aa15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm5624F6ZZG8 207 aa15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 NpeppsQ11011 920 aa15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Fam228bQ497Q6 232 aa15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Fchsd1Q6PFY1 688 aa15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Fam43aQ8BUP8 424 aa15.72■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Eef2kO08796 724 aa15.71■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Igbp1Q61249 340 aa15.71■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dcaf5Q80T85 946 aa15.71■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Bola3Q8CEI1 110 aa15.71■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nod2Q8K3Z0 1020 aa15.71■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Hip1rQ9JKY5 1068 aa15.71■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Iqgap3F8VQ29 1632 aa15.71■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 A0A1W2P7S8 802 aa15.71■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nfil3O08750 462 aa15.71■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cdc5lQ6A068 802 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Krt79Q8VED5 531 aa15.71■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Chaf1aQ9QWF0 911 aa15.71■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa15.71■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccdc129Q14B48 1034 aa15.71■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Asap2Q7SIG6 958 aa15.71■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa15.71■□□□□ 0.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Zfp853A0A1D5RM95 733 aa15.7■□□□□ 0.1
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 CltaO08585 235 aa15.7■□□□□ 0.1
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cap2Q9CYT6 476 aa15.7■□□□□ 0.1
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tubb4aQ9D6F9 444 aa15.7■□□□□ 0.1
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Palm3A2TJV2 734 aa15.7■□□□□ 0.1
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 PparaP23204 468 aa15.7■□□□□ 0.1
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gpr182P43142 395 aa15.7■□□□□ 0.1
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Plbd2Q3TCN2 594 aa15.7■□□□□ 0.1
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pnpla2Q8BJ56 486 aa15.7■□□□□ 0.1
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Kcnk13Q8R1P5 405 aa15.7■□□□□ 0.1
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dbndd1Q9CZ00 160 aa15.7■□□□□ 0.1
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Erbb4Q61527 1308 aa15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.6 ms