Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
Palm3A2TJV2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Palm3A2TJV2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Palm3A2TJV2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
Palm3A2TJV2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
Palm3A2TJV2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
Palm3A2TJV2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Palm3A2TJV2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Palm3A2TJV2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Palm3A2TJV2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Palm3A2TJV2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
Palm3A2TJV2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Palm3A2TJV2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Palm3A2TJV2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Palm3A2TJV2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Palm3A2TJV2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Palm3A2TJV2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Palm3A2TJV2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Palm3A2TJV2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Palm3A2TJV2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Palm3A2TJV2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Palm3A2TJV2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Palm3A2TJV2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Palm3A2TJV2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Palm3A2TJV2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Palm3A2TJV2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Palm3A2TJV2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Palm3A2TJV2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Palm3A2TJV2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Palm3A2TJV2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Palm3A2TJV2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Palm3A2TJV2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Palm3A2TJV2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Palm3A2TJV2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Palm3A2TJV2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Palm3A2TJV2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Palm3A2TJV2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Palm3A2TJV2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Palm3A2TJV2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Palm3A2TJV2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Palm3A2TJV2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Palm3A2TJV2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Palm3A2TJV2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Palm3A2TJV2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Palm3A2TJV2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Palm3A2TJV2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Palm3A2TJV2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Palm3A2TJV2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Palm3A2TJV2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Palm3A2TJV2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Palm3A2TJV2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Palm3A2TJV2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Palm3A2TJV2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Palm3A2TJV2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Palm3A2TJV2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Palm3A2TJV2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Palm3A2TJV2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Palm3A2TJV2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Palm3A2TJV2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Palm3A2TJV2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Palm3A2TJV2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Palm3A2TJV2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Palm3A2TJV2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Palm3A2TJV2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Palm3A2TJV2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Palm3A2TJV2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Palm3A2TJV2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Palm3A2TJV2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Palm3A2TJV2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Palm3A2TJV2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Palm3A2TJV2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Palm3A2TJV2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Palm3A2TJV2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Palm3A2TJV2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Palm3A2TJV2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Palm3A2TJV2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Palm3A2TJV2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Palm3A2TJV2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Palm3A2TJV2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Palm3A2TJV2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Palm3A2TJV2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Palm3A2TJV2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Palm3A2TJV2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Palm3A2TJV2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Palm3A2TJV2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Palm3A2TJV2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Palm3A2TJV2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Palm3A2TJV2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Palm3A2TJV2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Palm3A2TJV2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Palm3A2TJV2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Palm3A2TJV2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Palm3A2TJV2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Palm3A2TJV2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Palm3A2TJV2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Palm3A2TJV2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Palm3A2TJV2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Palm3A2TJV2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Palm3A2TJV2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Palm3A2TJV2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms