RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 RDH8Q9NYR8 311 aa24.06■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 IL17RELQ6ZVW7 336 aa24.06■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF439Q8NDP4 499 aa24.06■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 ST6GAL2Q96JF0 529 aa24.06■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 ZNRD1Q9P1U0 126 aa24.06■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 TOR1AO14656 332 aa24.05■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 ARG1P05089 322 aa24.05■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF134P52741 427 aa24.05■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa24.04■■□□□ 1.44
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC31A2O15432 143 aa24.04■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
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ECHS1-201ENST00000368547 IGHV1-69P01742 117 aa24.04■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 PI3P19957 117 aa24.04■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 Q3ZCU0 254 aa24.04■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 OR11H7Q8NGC8 314 aa24.04■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 FAM216AQ8WUB2 273 aa24.04■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 MITD1Q8WV92 249 aa24.04■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM160Q9NX00 188 aa24.04■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 ODF3BA8MYP8 253 aa24.03■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 IGLV1-47P01700 117 aa24.03■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 PRRX1P54821 245 aa24.03■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 ABCA11PQ4W5N1 156 aa24.03■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 CT45A1Q5HYN5 189 aa24.03■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 LY6G6FQ5SQ64 297 aa24.03■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa24.03■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 C11orf88Q6PI97 169 aa24.03■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 BRD3OSQ6XYD6 125 aa24.03■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 OR2AK2Q8NG84 335 aa24.03■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 CT45A3Q8NHU0 189 aa24.03■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 SFT2D2O95562 160 aa24.02■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 CD300CQ08708 224 aa24.02■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 TEX29Q8N6K0 151 aa24.02■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 C8orf31Q8N9H6 132 aa24.02■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa24.02■■□□□ 1.44
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF596Q8TC21 504 aa24.02■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa24.02■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 VAMP1P23763 118 aa24.02■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 GNRHRP30968 328 aa24.02■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 PIGPP57054 158 aa24.02■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 RND3P61587 244 aa24.02■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 EDARADDQ8WWZ3 215 aa24.02■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 PHB2Q99623 299 aa24.02■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa24.02■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 SLC5A7Q9GZV3 580 aa24.02■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 SLC2A9Q9NRM0 540 aa24.02■■□□□ 1.44
ECHS1-201ENST00000368547 A0A0B4J2A0 478 aa24.01■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa24.01■■□□□ 1.43
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ECHS1-201ENST00000368547 IGKV1-13P0DP09 117 aa24.01■■□□□ 1.43
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ECHS1-201ENST00000368547 HNF1AP20823 631 aa24.01■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 LUMP51884 338 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
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ECHS1-201ENST00000368547 TCTE3Q8IZS6 198 aa24.01■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 PIP4P2Q8N4L2 257 aa24.01■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 OR4P4Q8NGL7 312 aa24.01■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 SHPKQ9UHJ6 478 aa24.01■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 NUP50Q9UKX7 468 aa24.01■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 GPR31O00270 319 aa24■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 CD83Q01151 205 aa24■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 LINC00311Q8N616 119 aa24■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 SECTM1Q8WVN6 248 aa24■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 ST8SIA5O15466 376 aa23.99■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 CXCL3P19876 107 aa23.99■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 SAA4P35542 130 aa23.99■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 LGALS4P56470 323 aa23.99■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 OR10X1Q8NGY0 326 aa23.99■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 GALNT14Q96FL9 552 aa23.99■■□□□ 1.43
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ECHS1-201ENST00000368547 HIVEP2P31629 2446 aa23.99■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 ITGB1BP1O14713 200 aa23.99■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 ANXA3P12429 323 aa23.99■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 MIDNQ504T8 468 aa23.99■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 LDLRAD3Q86YD5 345 aa23.99■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 MGAT4CQ9UBM8 478 aa23.99■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 OR8U9P0C7N5 309 aa23.98■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 SRP14P37108 136 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 MSMO1Q15800 293 aa23.98■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa23.98■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 CMTM1Q8IZ96 169 aa23.98■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 BVESQ8NE79 360 aa23.98■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 OR8U1Q8NH10 309 aa23.98■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 AKR1E2Q96JD6 320 aa23.98■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 AGMATQ9BSE5 352 aa23.98■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 IFI27L2Q9H2X8 130 aa23.98■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 NAA60Q9H7X0 242 aa23.98■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa23.98■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa23.97■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 IFNA2P01563 188 aa23.97■■□□□ 1.43
ECHS1-201ENST00000368547 HLA-GP17693 338 aa23.97■■□□□ 1.43
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