RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 GDAP1Q8TB36 358 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 TESCQ96BS2 214 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAAP24Q9BTP7 215 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHID1Q9BWS9 393 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 RIBC2Q9H4K1 309 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC2A9Q9NRM0 540 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 MED29Q9NX70 200 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHRNA9Q9UGM1 479 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 TFR2Q9UP52 801 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 UPK1BO75841 260 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 PMP2P02689 132 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 EMP1P54849 157 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARF5P84085 180 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRAM2Q15035 370 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC183Q5T5S1 534 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM27BQ5VT28 67 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 C11orf88Q6PI97 169 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC00311Q8N616 119 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 FADS6Q8N9I5 356 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 ASZ1Q8WWH4 475 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 ECHDC3Q96DC8 303 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRRC39Q96DD0 335 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 COQ2Q96H96 371 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANAPC13Q9BS18 74 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 WDR54Q9H977 334 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC35D1Q9NTN3 355 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 TIMM9Q9Y5J7 89 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCA1O95477 2261 aa-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF727A8MUV8 499 aa-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB29O14966 203 aa-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 ERLIN1O75477 346 aa-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCGNO76038 276 aa-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 GABRA2P47869 451 aa-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 ROMO1P60602 79 aa-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDKL4Q5MAI5 379 aa-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 CMC1Q7Z7K0 106 aa-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q86TA4 180 aa-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 CMTM1Q8IZ96 169 aa-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF619Q8N2I2 560 aa-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR6K3Q8NGY3 331 aa-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR5K2Q8NHB8 316 aa-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPR151Q8TDV0 419 aa-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCL17Q92583 94 aa-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 IMMP2LQ96T52 175 aa-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC01587Q99440 93 aa-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR51B5Q9H339 312 aa-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 CRLF2Q9HC73 371 aa-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 SDHAF3Q9NRP4 125 aa-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCML1Q9UN30 329 aa-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 MGAMO43451 1857 aa-3.31□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A0B4J2E0 115 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR2AT4A6NND4 320 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM250H0YL14 139 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 REG1AP05451 166 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB5AP20339 215 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 M6PRP20645 277 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 TAS2R30P59541 319 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPA4Q13156 261 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCARB2Q14108 478 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACSM3Q53FZ2 586 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 TTC32Q5I0X7 151 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 C1orf137Q5JT78 98 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q5VSD8 79 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 TEX261Q6UWH6 196 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 WDR82Q6UXN9 313 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 IDO2Q6ZQW0 420 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 IQCKQ8N0W5 287 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCNYL1Q8N7R7 359 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR1L4Q8NGR5 311 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 C11orf49Q9H6J7 331 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLN6Q9NWW5 311 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 TNFSF18Q9UNG2 199 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 ORC6Q9Y5N6 252 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 U3KQ87 197 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 AKAP9Q99996 3911 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 LSM8O95777 96 aaKnown RBP-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 NPYP01303 97 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPBPP02775 128 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 ASAH2BP0C7U1 165 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 PSMB8P28062 276 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 RBM11P57052 281 aaKnown RBP-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 ETFRF1Q6IPR1 90 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPATA12Q7Z6I5 190 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC110Q8TBZ0 833 aa-3.33□□□□□ -2.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms