RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 INSIG2Q9Y5U4 225 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 KPTNQ9Y664 436 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.536e-7■■■□□ 15.2
PRPF8-210ENST00000574217 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa5.49□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa5.49□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 C17orf98A8MV24 154 aa5.49□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 M0QYG6 137 aa5.49□□□□□ -1.53
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PRPF8-210ENST00000574217 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 PALMDQ9NP74 551 aa5.48□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 SIRT7Q9NRC8 400 aa5.48□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 MCUBQ9NWR8 336 aa5.48□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 TMEM160Q9NX00 188 aa5.48□□□□□ -1.53
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PRPF8-210ENST00000574217 ZNF69Q9UC07 566 aa5.48□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 AUP1Q9Y679 476 aa5.48□□□□□ -1.53
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