RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568316.1

RBBP6-211, Transcript of RB binding protein 6, ubiquitin ligase, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP6, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6-211ENST00000568316 ADAM30Q9UKF2 790 aa20.19■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 PSG11Q9UQ72 335 aa20.19■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 A6NHS1 94 aa20.18■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 TMEM30BQ3MIR4 351 aa20.18■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 CNIH2Q6PI25 160 aa20.18■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa20.18■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 SNX29P2Q8IUI4 249 aa20.18■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 OR9G1Q8NH87 305 aa20.18■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa20.17■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 A0A1W2PPE3 182 aa20.17■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 MEIS3P1A6NDR6 274 aa20.17■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 FABP7O15540 132 aa20.17■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 HLA-DQB1P01920 261 aa20.17■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 KIR2DS4P43632 304 aa20.17■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 KIR2DS1Q14954 304 aa20.17■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 ZNF596Q8TC21 504 aa20.17■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 FAM96BQ9Y3D0 163 aa20.17■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 SVEP1Q4LDE5 3571 aa20.16■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 FCER2P06734 321 aa20.16■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 GSTT2P0CG29 244 aa20.16■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 GSTT2BP0CG30 244 aa20.16■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 HTD2P86397 168 aa20.16■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa20.16■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa20.16■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 OR4P4Q8NGL7 312 aa20.16■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 OR1A1Q9P1Q5 309 aa20.16■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 SLC23A1Q9UHI7 598 aa20.16■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 JPT1Q9UK76 154 aa20.16■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa20.15■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 J3QR06 171 aa20.15■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 IGLV1-47P01700 117 aa20.15■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 PAX6P26367 422 aa20.15■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 PRSS3P35030 304 aa20.15■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 PRRX1P54821 245 aa20.15■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 HERPUD1Q15011 391 aa20.15■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 HLA-DRB5Q30154 266 aa20.15■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 GVQW1Q8N7I0 195 aa20.15■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 BEND2Q8NDZ0 799 aa20.15■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 DIRAS2Q96HU8 199 aa20.15■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 AJUBAQ96IF1 538 aa20.15■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RBBP6-211ENST00000568316 SLC31A2O15432 143 aa20.14■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 HTR1DP28221 377 aa20.14■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa20.14■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 MORN2Q502X0 79 aa20.14■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 IGSF11Q5DX21 431 aa20.14■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 STEAP3Q658P3 488 aa20.14■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 Q6ZS49 121 aa20.14■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 OR4A4PQ8NGN8 299 aa20.14■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 ZDHHC16Q969W1 377 aa20.14■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 MMP28Q9H239 520 aa20.14■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 MMP27Q9H306 513 aa20.14■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 BET1O15155 118 aa20.13■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 HSPA12AO43301 675 aa20.13■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 FBP1P09467 338 aa20.13■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 TUSC1Q2TAM9 212 aa20.13■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 MINOS1Q5TGZ0 78 aa20.13■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 ZNF439Q8NDP4 499 aa20.13■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 OCSTAMPQ9BR26 566 aa20.13■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 IFT46Q9NQC8 304 aa20.13■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa20.13■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa20.12■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 YPEL1O60688 119 aa20.12■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 TNFSF8P32971 234 aa20.12■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 CBX5P45973 191 aa20.12■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 SSX2Q16385 188 aa20.12■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 HOGA1Q86XE5 327 aa20.12■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 DYNAPQ8N1N2 210 aa20.12■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 BEST4Q8NFU0 473 aa20.12■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 OR10X1Q8NGY0 326 aa20.12■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 YPEL2Q96QA6 119 aa20.12■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 ABHD1Q96SE0 405 aa20.12■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 CABLES2Q9BTV7 478 aa20.12■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 HILPDAQ9Y5L2 63 aa20.12■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 A3GALT2U3KPV4 340 aa20.12■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP20.11■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 RGS11O94810 467 aa20.11■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 LPLP06858 475 aa20.11■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 ZBTB25P24278 435 aa20.11■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 ZNF134P52741 427 aa20.11■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 Q3ZCU0 254 aa20.11■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 PLA1AQ53H76 456 aa20.11■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 CT45A1Q5HYN5 189 aa20.11■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 CT45A3Q8NHU0 189 aa20.11■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 BATF3Q9NR55 127 aa20.11■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 DPM3Q9P2X0 92 aa20.11■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 IFNA2P01563 188 aa20.1■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 S100A5P33763 92 aa20.1■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 CEACAM6P40199 344 aa20.1■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 C8orf31Q8N9H6 132 aa20.1■□□□□ 0.81
RBBP6-211ENST00000568316 GPX8Q8TED1 209 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.1 ms