RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487436.1

GPBP1L1-209, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1 like 1, human

TSL 2

Gene GPBP1L1, Length 560 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPBP1L1-209	ENST00000487436	ZNF846	Q147U1	533 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	HERPUD1	Q15011	391 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	HMGN3	Q15651	99 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	FAM189A2	Q15884	450 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	C6orf183	Q5T699	404 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	TMEM17	Q86X19	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436		Q8N7P7	452 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	OR56B4	Q8NH76	319 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	GPX8	Q8TED1	209 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	TOMM40L	Q969M1	308 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	TBX15	Q96SF7	602 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	GINS4	Q9BRT9	223 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	RNF150	Q9ULK6	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	AKAP9	Q99996	3911 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436		A0A0A6YYH2	397 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436		A6NJ64	397 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436		A8MXK9	166 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	HSD17B6	O14756	317 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	SPINT2	O43291	252 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	TNFSF12	O43508	249 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	TMEM127	O75204	238 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	RBBP9	O75884	186 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	RAB3D	O95716	219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	AMY2A	P04746	511 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	ARG1	P05089	322 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	GLA	P06280	429 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	MELTF	P08582	738 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	INHBB	P09529	407 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	IL7	P13232	177 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	CD99	P14209	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	PGAM2	P15259	253 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	PI3	P19957	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	AADAC	P22760	399 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	DTYMK	P23919	212 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	FCGR2C	P31995	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	RCVRN	P35243	200 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	CEACAM6	P40199	344 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	KCNJ3	P48549	501 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	NPY4R	P50391	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	LINC00205	P59089	165 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	IFITM3	Q01628	133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	PAX2	Q02962	417 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	BAMBI	Q13145	260 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	C17orf50	Q8WW18	174 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	S100Z	Q8WXG8	99 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1L1-209	ENST00000487436	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms