RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 LOXL3P58215 753 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 GPR176Q14439 515 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 SPIN3Q5JUX0 258 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 Q6P435 159 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 CNIH2Q6PI25 160 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 HEPN1Q6WQI6 88 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 CCDC190Q86UF4 302 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 Q96M66 194 aa10.07□□□□□ -0.8
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PRAME-212ENST00000485532 SLC25A33Q9BSK2 321 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 CST11Q9H112 138 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 LPAR5Q9H1C0 372 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 GLS2Q9UI32 602 aa10.07□□□□□ -0.8
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PRAME-212ENST00000485532 FAM25GB3EWG6 89 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
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PRAME-212ENST00000485532 LINC00299Q6ZSB3 139 aa10.06□□□□□ -0.8
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PRAME-212ENST00000485532 ATG5Q9H1Y0 275 aa10.05□□□□□ -0.8
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PRAME-212ENST00000485532 SOCS1O15524 211 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 OR2F2O95006 317 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 CD34P28906 385 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 BRS3P32247 399 aa10.04□□□□□ -0.8
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PRAME-212ENST00000485532 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 V9GYH0 126 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 A0A0A6YYH2 397 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 FAM90A10PA6NDY2 464 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 FAM90A18PA6NE21 464 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 FAM90A16PA6NEW6 464 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa10.03□□□□□ -0.8
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