RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567060.5

CLN6-208, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, human

TSL 2

Gene CLN6, Length 945 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLN6-208	ENST00000567060	CDK2	P24941	298 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-208	ENST00000567060	TALDO1	P37837	337 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-208	ENST00000567060	MNDA	P41218	407 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-208	ENST00000567060	KIR2DS4	P43632	304 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-208	ENST00000567060	ARFRP1	Q13795	201 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-208	ENST00000567060	KIR2DS1	Q14954	304 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-208	ENST00000567060	MIDN	Q504T8	468 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-208	ENST00000567060	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-208	ENST00000567060		Q6ZS49	121 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-208	ENST00000567060	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-208	ENST00000567060	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-208	ENST00000567060	OR4K15	Q8NH41	348 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-208	ENST00000567060	ARL11	Q969Q4	196 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-208	ENST00000567060	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-208	ENST00000567060	KIRREL1	Q96J84	757 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-208	ENST00000567060	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-208	ENST00000567060	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-208	ENST00000567060	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-208	ENST00000567060	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-208	ENST00000567060	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		13.65	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	TCF21	O43680	179 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	CBX5	P45973	191 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	GNG2	P59768	71 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	HTD2	P86397	168 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	HMGN3	Q15651	99 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	STEAP3	Q658P3	488 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	ZNF596	Q8TC21	504 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	CCDC107	Q8WV48	283 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	LHX4	Q969G2	390 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	GALM	Q96C23	342 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	MMP27	Q9H306	513 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060		Q9N2K0	584 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	C12orf77	C9JDV5	145 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	EPHA1	P21709	976 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	SSTR5	P35346	364 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	JPT1	Q9UK76	154 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	RGS5	O15539	181 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	HPGDS	O60760	199 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	RGS11	O94810	467 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	HBZ	P02008	142 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	FCGR3A	P08637	254 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	ELK1	P19419	428 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	PRRX1	P54821	245 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	HLA-DRB3	P79483	266 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	ZNF626	Q68DY1	528 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	HCP5	Q6MZN7	132 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	OR9G1	Q8NH87	305 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	MCFD2	Q8NI22	146 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060		A0A0A6YYJ9	748 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	TMEM235	A6NFC5	223 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060		A6NHS1	94 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	ODF3B	A8MYP8	253 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	FAM25A	B3EWG3	89 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	FAM25C	B3EWG5	89 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	FAM25G	B3EWG6	89 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	TRDC	B7Z8K6	153 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	SULT1C2	O00338	296 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	NPFF	O15130	113 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	LGALS4	P56470	323 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	TAS2R20	P59543	309 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	YPEL1	O60688	119 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	MMP23A	O75900	390 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	VENTX	O95231	258 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	TG	P01266	2768 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	CTXN2	P0C2S0	81 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	LOXL3	P58215	753 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	PNKD	Q8N490	385 aa		13.6	□□□□□ -0.23

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