Protein–RNA interactions for Protein: P79483

HLA-DRB3, HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRB3P79483 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HLA-DRB3P79483 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HLA-DRB3P79483 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HLA-DRB3P79483 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
HLA-DRB3P79483 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HLA-DRB3P79483 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HLA-DRB3P79483 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HLA-DRB3P79483 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HLA-DRB3P79483 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-DRB3P79483 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HLA-DRB3P79483 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DRB3P79483 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HLA-DRB3P79483 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HLA-DRB3P79483 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HLA-DRB3P79483 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HLA-DRB3P79483 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HLA-DRB3P79483 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HLA-DRB3P79483 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HLA-DRB3P79483 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-DRB3P79483 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-DRB3P79483 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HLA-DRB3P79483 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-DRB3P79483 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HLA-DRB3P79483 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-DRB3P79483 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-DRB3P79483 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HLA-DRB3P79483 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HLA-DRB3P79483 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HLA-DRB3P79483 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HLA-DRB3P79483 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HLA-DRB3P79483 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HLA-DRB3P79483 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-DRB3P79483 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-DRB3P79483 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-DRB3P79483 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DRB3P79483 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DRB3P79483 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DRB3P79483 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DRB3P79483 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DRB3P79483 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DRB3P79483 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DRB3P79483 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-DRB3P79483 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DRB3P79483 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLA-DRB3P79483 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-DRB3P79483 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-DRB3P79483 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DRB3P79483 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DRB3P79483 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DRB3P79483 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DRB3P79483 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DRB3P79483 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DRB3P79483 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DRB3P79483 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DRB3P79483 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DRB3P79483 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DRB3P79483 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-DRB3P79483 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-DRB3P79483 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-DRB3P79483 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DRB3P79483 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DRB3P79483 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DRB3P79483 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DRB3P79483 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DRB3P79483 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DRB3P79483 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DRB3P79483 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DRB3P79483 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DRB3P79483 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DRB3P79483 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DRB3P79483 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DRB3P79483 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DRB3P79483 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DRB3P79483 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DRB3P79483 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DRB3P79483 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DRB3P79483 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DRB3P79483 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DRB3P79483 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DRB3P79483 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DRB3P79483 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-DRB3P79483 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-DRB3P79483 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-DRB3P79483 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DRB3P79483 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DRB3P79483 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DRB3P79483 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DRB3P79483 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DRB3P79483 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DRB3P79483 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DRB3P79483 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DRB3P79483 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DRB3P79483 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DRB3P79483 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DRB3P79483 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DRB3P79483 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DRB3P79483 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-DRB3P79483 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-DRB3P79483 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-DRB3P79483 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms