RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLEC9AQ6UXN8 241 aa14□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPAG16Q8N0X2 631 aa14□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR1J1Q8NGS3 322 aa14□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SARAFQ96BY9 339 aa14□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NRIP2Q9BQI9 281 aa14□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM210A6NLX4 147 aa13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C3orf80F5H4A9 247 aa13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR2H2O95918 312 aa13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPP1P10451 314 aa13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PSG7Q13046 419 aa13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF154Q13106 437 aa13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF146Q15072 292 aa13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 Q6ZRG5 221 aa13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WNT2BQ93097 391 aa13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SEC11CQ9BY50 192 aa13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 F8W036 122 aa13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WISP2O76076 250 aa13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 F2RP25116 425 aa13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 S100GP29377 79 aa13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NHLH2Q02577 135 aa13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ALKBH6Q3KRA9 238 aa13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF497Q6ZNH5 498 aa13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR2C3Q8N628 320 aa13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C9orf106Q8NAJ2 232 aa13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TREM1Q9NP99 234 aa13.99□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADAM20O43506 726 aa13.98□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SWI5Q1ZZU3 235 aa13.98□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WDR31Q8NA23 367 aa13.98□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa13.98□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPHA2Q96T91 129 aa13.98□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDIPTO14735 213 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CEACAM4O75871 244 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CD5P06127 495 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DANCRP0C864 163 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MMP9P14780 707 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ID3Q02535 119 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GUCA2BQ16661 112 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VWA1Q6PCB0 445 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR10V1Q8NGI7 309 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM231Q9H6L2 316 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HES4Q9HCC6 221 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM74A7A6NL05 159 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIM77I1YAP6 450 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SIRPB1O00241 398 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SH2D1BO14796 132 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TUBG1P23258 451 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HOXC12P31275 282 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR8G1Q15617 311 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM74A3Q4VXF1 159 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TLNRD1Q9H1K6 362 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TUBG2Q9NRH3 451 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WIPI2Q9Y4P8 454 aa13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM24AA6NFZ4 105 aa13.96□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa13.96□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TNFSF12O43508 249 aa13.96□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NXPH2O95156 264 aa13.96□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MPV17P39210 176 aa13.96□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RAB5CP51148 216 aa13.96□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AKR1E2Q96JD6 320 aa13.96□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC25A31Q9H0C2 315 aa13.96□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR1A1Q9P1Q5 309 aa13.96□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM96BQ9Y3D0 163 aa13.96□□□□□ -0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGSF23A1L1A6 192 aa13.95□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AHRRA9YTQ3 701 aa13.95□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa13.95□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 H0YL77 283 aa13.95□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PITX3O75364 302 aa13.95□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGLV2-14P01704 120 aa13.95□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC25A6P12236 298 aa13.95□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF266Q14584 549 aa13.95□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TESK1Q15569 626 aa13.95□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HMGN3Q15651 99 aa13.95□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COMMD1Q8N668 190 aa13.95□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR8G5Q8NG78 346 aa13.95□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IL1F10Q8WWZ1 152 aa13.95□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LUZP4Q9P127 313 aa13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.9 ms