RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF586Q9NXT0 402 aa14.45□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DOCK4Q8N1I0 1966 aa14.45□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBFOX3A6NFN3 312 aa14.45□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC31A2O15432 143 aa14.45□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYC1P08574 325 aa14.45□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STARD6P59095 220 aa14.45□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SSMEM1Q8WWF3 244 aa14.45□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C21orf140B9A014 251 aa14.45□□□□□ -0.1
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAMTQ14353 236 aa14.45□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGSF11Q5DX21 431 aa14.45□□□□□ -0.1
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTTY12Q9BZ98 90 aa14.45□□□□□ -0.1
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NHLH2Q02577 135 aa14.44□□□□□ -0.1
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR5A2Q8NGI9 324 aa14.44□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.43□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEC14L6B5MCN3 397 aa14.43□□□□□ -0.1
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF260Q3ZCT1 412 aa14.42□□□□□ -0.1
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NMBP08949 121 aa14.42□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APELAP0DMC3 54 aa14.42□□□□□ -0.1
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SHANK1Q9Y566 2161 aa14.42□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNPH1O43598 174 aa14.41□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GYPAP02724 150 aa14.41□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFITM2Q01629 132 aa14.41□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FNDC7Q5VTL7 733 aa14.41□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM147Q9BVK8 224 aa14.41□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00862A6NCI5 91 aa14.41□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TGFBR3LH3BV60 316 aa14.41□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GALR1P47211 349 aa14.41□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERVS71-1P61550 626 aa14.41□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DOCK7Q96N67 2140 aa14.41□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ST8SIA5O15466 376 aa14.41□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAMP1O60894 148 aa14.41□□□□□ -0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD1AP06126 327 aa14.41□□□□□ -0.1
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