RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550407.1

TARBP2-215, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, human

TSL 5

Gene TARBP2, Length 1,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP2-215	ENST00000550407	UBE2QL1	A1L167	161 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	FUOM	A2VDF0	154 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	TMEM235	A6NFC5	223 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	GABARAP	H6UMI1	98 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	MGST3	O14880	152 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	TMPRSS2	O15393	492 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	ADAM20	O43506	726 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	NDUFB3	O43676	98 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	PSPN	O60542	156 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	ZNF737	O75373	536 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	AMY2B	P19961	511 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	CBX5	P45973	191 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	PAX5	Q02548	391 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	MADCAM1	Q13477	382 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	ZNF79	Q15937	498 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	BRICD5	Q6PL45	260 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	CCDC32	Q9BV29	185 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	SRR	Q9GZT4	340 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	ETAA1	Q9NY74	926 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	AK3	Q9UIJ7	227 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	METRN	Q9UJH8	293 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-215	ENST00000550407		A8MXK9	166 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	RBBP9	O75884	186 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	TK1	P04183	234 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	LPL	P06858	475 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	SRD5A1	P18405	259 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	HNF1A	P20823	631 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	OR3A1	P47881	315 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	GRK1	Q15835	563 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	OR8H2	Q8N162	312 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407		Q8N402	240 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	GPX8	Q8TED1	209 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	CHST6	Q9GZX3	395 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	PPA2	Q9H2U2	334 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	COL6A5	A8TX70	2615 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	HSPB6	O14558	160 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	GPR37	O15354	613 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	TFF1	P04155	84 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	PTHLH	P12272	177 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	DTYMK	P23919	212 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	NPY4R	P50391	375 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	OR8B2	Q96RD0	313 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	MEIOC	A2RUB1	952 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	SSX5	O60225	188 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	NAPSA	O96009	420 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	WNT2	P09544	360 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	GSTT2B	P0CG30	244 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	ACTB	P60709	375 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	ACTG1	P63261	375 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	GAPT	Q8N292	157 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	OR52I2	Q8NH67	350 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	IFT46	Q9NQC8	304 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-215	ENST00000550407	DVL1	O14640	695 aa		12.05	□□□□□ -0.48

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.1 ms