RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355396.7

SUSD1-201, Transcript of sushi domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene SUSD1, Length 2,861 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1-201ENST00000355396 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.61□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 RPS2P15880 293 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 IL2RGP31785 369 aa9.61□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 PRSS3P35030 304 aa9.61□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 COL10A1Q03692 680 aa9.61□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 NLRC3Q7RTR2 1065 aa9.61□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 C8orf46Q8TAG6 207 aa9.61□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 SELENOIQ9C0D9 397 aa9.61□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 BANF2Q9H503 90 aa9.61□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 SPACA1Q9HBV2 294 aa9.61□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 AKAP9Q99996 3911 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 TRAV24A0A0B4J272 114 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 ERP29P30040 261 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 KCNJ3P48549 501 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 GMFBP60983 142 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 PAX2Q02962 417 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 FAM216BQ8N7L0 139 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 OR4D10Q8NGI6 311 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 OR5D13Q8NGL4 314 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 HSF4Q9ULV5 492 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 PCDHB10Q9UN67 800 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 A0A1B0GW55 424 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 SULT1C2O00338 296 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 TMPRSS2O15393 492 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 PSPNO60542 156 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 RBBP9O75884 186 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 CCNKO75909 580 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 MPIG6BO95866 241 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 TK1P04183 234 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 DUX4L2P0CJ85 424 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 DUX4L3P0CJ86 424 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 DUX4L4P0CJ87 422 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 DUX4L5P0CJ88 424 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 DUX4L6P0CJ89 424 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 DUX4L7P0CJ90 424 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 AP3S2P59780 193 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 BTN2A1Q7KYR7 527 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 GAPTQ8N292 157 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 PHF21AQ96BD5 680 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 COPZ2Q9P299 210 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 DUX4Q9UBX2 424 aa9.6□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 A0A0A6YYJ9 748 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 C7orf66A4D0T2 115 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 TMEM235A6NFC5 223 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 NAP1L6A6NFF2 107 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 DVL1O14640 695 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 DEGS1O15121 323 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 LPLP06858 475 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 MELTFP08582 738 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 GSTT2BP0CG30 244 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 CHATP28329 748 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 GABRA2P47869 451 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 OR3A1P47881 315 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 TAF9Q16594 264 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 LY6G5BQ8NDX9 201 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 OR4C16Q8NGL9 310 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 GHITMQ9H3K2 345 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 OR14J1Q9UGF5 321 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 OTOGQ6ZRI0 2925 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 METTL21EPA6NDL7 271 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 FAM157AC9JC47 383 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 NDUFB3O43676 98 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 SCGNO76038 276 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 TFF1P04155 84 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 FUT3P21217 361 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 DUSP1P28562 367 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 VEGFCP49767 419 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 IKZF1Q13422 519 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 PLAC9Q5JTB6 97 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 ATAD3CQ5T2N8 411 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 RAB12Q6IQ22 244 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 ZNRF1Q8ND25 227 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 PPP1R35Q8TAP8 253 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 C20orf85Q9H1P6 137 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 SCPEP1Q9HB40 452 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 ZNF581Q9P0T4 197 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 FLVCR2Q9UPI3 526 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 KCNK7Q9Y2U2 307 aa9.59□□□□□ -0.87
SUSD1-201ENST00000355396 CSMD1Q96PZ7 3565 aa9.58□□□□□ -0.88
SUSD1-201ENST00000355396 A8MV72 311 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SUSD1-201ENST00000355396 MGST3O14880 152 aa9.58□□□□□ -0.88
SUSD1-201ENST00000355396 PDCD6O75340 191 aa9.58□□□□□ -0.88
SUSD1-201ENST00000355396 FOXH1O75593 365 aa9.58□□□□□ -0.88
SUSD1-201ENST00000355396 CSF1P09603 554 aa9.58□□□□□ -0.88
SUSD1-201ENST00000355396 IGHV4-31P0DP07 118 aa9.58□□□□□ -0.88
SUSD1-201ENST00000355396 TMEM50BP56557 158 aa9.58□□□□□ -0.88
SUSD1-201ENST00000355396 TMEM249Q2WGJ8 235 aa9.58□□□□□ -0.88
SUSD1-201ENST00000355396 Q6ZTK2 550 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms