RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520931.5

TNIP1-208, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNIP1, Length 2,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1-208ENST00000520931 HMGN3Q15651 99 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 NANPQ8TBE9 248 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 LINC01387J3KSC0 135 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 CELA3AP09093 270 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 SULT1A1P50225 295 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 RUNX1Q01196 453 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 PRDX4Q13162 271 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 HERPUD1Q15011 391 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 ZNF488Q96MN9 340 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 SLC35B3Q9H1N7 401 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 OR51B6Q9H340 312 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 K7N7A8 449 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 MT-ND4LP03901 98 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 TK1P04183 234 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 FOLR2P14207 255 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 UCP2P55851 309 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 IGFBP7Q16270 282 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 OR5C1Q8NGR4 320 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 EGLN1Q9GZT9 426 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 CALHM2Q9HA72 323 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 CCL28Q9NRJ3 127 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 GLRX2Q9NS18 164 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 ZNF391Q9UJN7 358 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 IFNA4P05014 189 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 COMMD1Q8N668 190 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 TCFL5Q9UL49 500 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 R4GN57 208 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 TMEM50AO95807 157 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 NGFP01138 241 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 ZNF806P0C7X5 589 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 CYB561P49447 251 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 VAMP2P63027 116 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 LPAL2Q16609 132 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 HAGHQ16775 308 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 PBDC1Q9BVG4 233 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 HES7Q9BYE0 225 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 PRRG4Q9BZD6 226 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 MTCH1Q9NZJ7 389 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 NCOR1O75376 2440 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 PROB1E7EW31 1015 aa14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 CYTIPO60759 359 aa14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 EPHA1P21709 976 aa14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 TMEM252Q8N6L7 170 aa14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 Q9N2K0 584 aa14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 C5orf52A6NGY3 159 aa14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 SLC22A20A6NK97 555 aa14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 ZNF732B4DXR9 585 aa14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 H3BP45 60 aa14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 SYNGR1O43759 233 aa14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 CDS2O95674 445 aa14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 FBP1P09467 338 aa14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 RAB5AP20339 215 aa14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 RAB5CP51148 216 aa14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 DYNLT3P51808 116 aa14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 FABP9Q0Z7S8 132 aa14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 IFT22Q9H7X7 185 aa14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 GPR179Q6PRD1 2367 aa14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 MED13Q9UHV7 2174 aa14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-208ENST00000520931 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 TRIM61Q5EBN2 209 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 SOHLH1Q5JUK2 328 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 TUSC5Q8IXB3 177 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 SUMF2Q8NBJ7 301 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 SPSB4Q96A44 273 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 C11orf1Q9H5F2 150 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 FAM86C1Q9NVL1 165 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 PCSK5Q92824 1860 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 HS3ST1O14792 307 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 PAX6P26367 422 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 ZNF154Q13106 437 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 RDH5Q92781 318 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 MED12LQ86YW9 2145 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 NQO2P16083 231 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 LMO1P25800 156 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 GFRA1P56159 465 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 CTAG1AP78358 180 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 ZNF266Q14584 549 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 C20orf204Q6ZNR8 217 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 ODF3L1Q8IXM7 274 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 ZNF561Q8N587 486 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 PRDM14Q9GZV8 571 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa14.89□□□□□ -0.03
TNIP1-208ENST00000520931 LRFN1Q9P244 771 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.7 ms