RNA–Protein interactions for RNA: YHR201C

PPX1, Transcript of Exopolyphosphatase, yeast

Gene PPX1, Length 1,194 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPX1	YHR201C	TAF3	Q12297	353 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPX1	YHR201C	ADY2	P25613	283 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	FLO10	P36170	1169 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
PPX1	YHR201C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
PPX1	YHR201C	DSS1	P39112	969 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	ARG2	P40360	574 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	CAF16	P43569	289 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	IMO32	P53219	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	RPN4	Q03465	531 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	MDM12	Q92328	271 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	SPO11	P23179	398 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	GSY1	P23337	708 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	VBA3	P25594	458 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	PHO11	P35842	467 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	YKR051W	P36142	418 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	GLG1	P36143	616 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	PHO12	P38693	467 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	CTR1	P49573	406 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	ARO10	Q06408	635 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	MEF1	P25039	761 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	EMP70	P32802	667 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	NUP82	P40368	713 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	NHX1	Q04121	633 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	MLH3	Q12083	715 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	MIH1	P23748	554 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	HSL7	P38274	827 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	UBS1	P38290	277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	FHN1	P53279	174 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	REC102	Q02721	264 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	HOG1	P32485	435 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	BDH2	P39713	417 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	GET2	P40056	285 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	BUD6	P41697	788 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	COX18	P53239	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	ATG4	P53867	494 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	COQ11	Q05892	277 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	GCN2	P15442	1659 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	SRD1	P09007	221 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	YKR018C	P36114	725 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	YEL020C	P39994	560 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	PCL10	P53124	433 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	USV1	Q12132	391 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	CAT8	P39113	1433 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PPX1	YHR201C	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	RAD18	P10862	487 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	PHO8	P11491	566 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	MDM10	P18409	493 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	OCA5	P38738	679 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	ECM3	Q99252	613 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	RPN13	O13563	156 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	CIT2	P08679	460 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	PEX1	P24004	1043 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	SNM1	P40993	198 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	ARP4	P80428	489 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	THI7	Q05998	598 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	MSH2	P25847	964 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	THI4	P32318	326 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	PEX6	P33760	1030 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	YNL195C	P40168	261 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	GID8	P40208	455 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	SET3	P36124	751 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	FUB1	P25659	250 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	BCS1	P32839	456 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	MNN4	P36044	1178 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	APN2	P38207	520 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	AIM14	P53109	570 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	UGO1	Q03327	502 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	GMH1	P36125	273 aa		4.47	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	PIG2	P40187	538 aa		4.47	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	HOF1	Q05080	669 aa		4.47	□□□□□ -1.69
PPX1	YHR201C	ATG33	Q06485	197 aa		4.47	□□□□□ -1.69

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