RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP4	YHR069C	OSW7	P43611	510 aa		6.1	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	YOL098C	Q12496	1037 aa		6.1	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	BI2	P03873	423 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	BI4	P03879	638 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	HAP2	P06774	265 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	CDC4	P07834	779 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	ERG11	P10614	530 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	PEP7	P32609	515 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	SLA2	P33338	968 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	YBR284W	P38150	797 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	ASG7	P46993	209 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	SPC98	P53540	846 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.09	□□□□□ -1.43	not detected
RRP4	YHR069C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	SOV1	Q04748	898 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	YDR222W	Q04925	415 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	ESC8	Q08119	714 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	DAS2	Q12084	232 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RRP4	YHR069C	PRC1	P00729	532 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	GAL80	P04387	435 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	VBA3	P25594	458 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	PEX2	P32800	271 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	MRP4	P32902	394 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	GCS1	P35197	352 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	YKL050C	P35736	922 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	VBA5	P36172	582 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	CCL1	P37366	393 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	HMT1	P38074	348 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	APN2	P38207	520 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	MSC7	P38694	644 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	DSE1	P40077	573 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	YTA12	P40341	825 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	YGR021W	P53212	290 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	BOP3	P53958	396 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	OPY2	Q06810	360 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	YLR001C	Q07895	862 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	REC8	Q12188	680 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	YER152C	P10356	443 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	FRE1	P32791	686 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	YMC2	P38087	329 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	TBS1	P38114	1094 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	STB5	P38699	743 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	TCD1	P38756	429 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	YEL075C	P39972	122 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	FMP10	P40098	244 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	STU2	P46675	888 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.07	□□□□□ -1.44	not detected
RRP4	YHR069C	INP52	P50942	1183 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	MND1	P53102	219 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	MET13	P53128	600 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	YNL011C	P53980	444 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	SLG1	P54867	378 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	NGL3	Q03210	505 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	YDR278C	Q05612	105 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	TRE1	Q08919	783 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	AHC1	Q12433	566 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	VPS3	P23643	1011 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	GAC1	P28006	793 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	RRN6	P32786	894 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	KDX1	P36005	433 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	SIF2	P38262	535 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	SOH1	P38633	127 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	GEM1	P39722	662 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	YJR054W	P47114	497 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	BTN2	P53286	410 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	MUB1	Q03162	620 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	EAR1	Q03212	550 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	VPS54	Q12071	889 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	APM4	Q99186	491 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	URK1	P27515	501 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	GYP6	P32806	458 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	PEP12	P32854	288 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RRP4	YHR069C	ASG1	P40467	964 aa		6.05	□□□□□ -1.44

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