RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637667.1

CLN6-222, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CLN6, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-222ENST00000637667 DLGAP5Q15398 846 aa25.29■■□□□ 1.64
CLN6-222ENST00000637667 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.29■■□□□ 1.64
CLN6-222ENST00000637667 MOB2Q70IA6 237 aa25.29■■□□□ 1.64
CLN6-222ENST00000637667 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.29■■□□□ 1.64
CLN6-222ENST00000637667 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.29■■□□□ 1.64
CLN6-222ENST00000637667 NF2P35240 595 aa25.28■■□□□ 1.64
CLN6-222ENST00000637667 ABHD8Q96I13 439 aa25.28■■□□□ 1.64
CLN6-222ENST00000637667 JAG2Q9Y219 1238 aa25.28■■□□□ 1.64
CLN6-222ENST00000637667 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.27■■□□□ 1.64
CLN6-222ENST00000637667 CCER2I3L3R5 266 aa25.27■■□□□ 1.64
CLN6-222ENST00000637667 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
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CLN6-222ENST00000637667 USP44Q9H0E7 712 aa25.27■■□□□ 1.64
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CLN6-222ENST00000637667 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.27■■□□□ 1.64
CLN6-222ENST00000637667 F8W031 263 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CLN6-222ENST00000637667 CSRNP1Q96S65 589 aa25.26■■□□□ 1.63
CLN6-222ENST00000637667 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.26■■□□□ 1.63
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CLN6-222ENST00000637667 FAM205AQ6ZU69 1335 aa25.25■■□□□ 1.63
CLN6-222ENST00000637667 CFAP100Q494V2 611 aa25.24■■□□□ 1.63
CLN6-222ENST00000637667 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa25.24■■□□□ 1.63
CLN6-222ENST00000637667 LRRC24Q50LG9 513 aa25.23■■□□□ 1.63
CLN6-222ENST00000637667 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CLN6-222ENST00000637667 RNF186Q9NXI6 227 aa25.23■■□□□ 1.63
CLN6-222ENST00000637667 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.22■■□□□ 1.63
CLN6-222ENST00000637667 TRPA1O75762 1119 aa25.22■■□□□ 1.63
CLN6-222ENST00000637667 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CLN6-222ENST00000637667 SPDYE6P0CI01 402 aa25.22■■□□□ 1.63
CLN6-222ENST00000637667 METTL24Q5JXM2 366 aa25.22■■□□□ 1.63
CLN6-222ENST00000637667 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.22■■□□□ 1.63
CLN6-222ENST00000637667 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa25.22■■□□□ 1.63
CLN6-222ENST00000637667 MYO1BO43795 1136 aa25.21■■□□□ 1.63
CLN6-222ENST00000637667 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.21■■□□□ 1.63
CLN6-222ENST00000637667 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.21■■□□□ 1.63
CLN6-222ENST00000637667 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CLN6-222ENST00000637667 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.2■■□□□ 1.62
CLN6-222ENST00000637667 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.2■■□□□ 1.62
CLN6-222ENST00000637667 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.2■■□□□ 1.62
CLN6-222ENST00000637667 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
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CLN6-222ENST00000637667 VPS37DQ86XT2 251 aa25.19■■□□□ 1.62
CLN6-222ENST00000637667 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.19■■□□□ 1.62
CLN6-222ENST00000637667 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.19■■□□□ 1.62
CLN6-222ENST00000637667 AOX1Q06278 1338 aa25.18■■□□□ 1.62
CLN6-222ENST00000637667 PDE8BO95263 885 aa25.18■■□□□ 1.62
CLN6-222ENST00000637667 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
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CLN6-222ENST00000637667 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.16■■□□□ 1.62
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CLN6-222ENST00000637667 EYA2O00167 538 aa25.14■■□□□ 1.62
CLN6-222ENST00000637667 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
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CLN6-222ENST00000637667 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.14■■□□□ 1.61
CLN6-222ENST00000637667 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.13■■□□□ 1.61
CLN6-222ENST00000637667 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CLN6-222ENST00000637667 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
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CLN6-222ENST00000637667 MAP3K11Q16584 847 aa25.13■■□□□ 1.61
CLN6-222ENST00000637667 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.13■■□□□ 1.61
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CLN6-222ENST00000637667 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa25.13■■□□□ 1.61
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CLN6-222ENST00000637667 TNFAIP1Q13829 316 aa25.11■■□□□ 1.61
CLN6-222ENST00000637667 GRIK5Q16478 980 aa25.11■■□□□ 1.61
CLN6-222ENST00000637667 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CLN6-222ENST00000637667 SPRYD7Q5W111 196 aa25.11■■□□□ 1.61
CLN6-222ENST00000637667 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CLN6-222ENST00000637667 SREBF2Q12772 1141 aa25.1■■□□□ 1.61
CLN6-222ENST00000637667 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.1■■□□□ 1.61
CLN6-222ENST00000637667 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.09■■□□□ 1.61
CLN6-222ENST00000637667 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.09■■□□□ 1.61
CLN6-222ENST00000637667 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.09■■□□□ 1.61
CLN6-222ENST00000637667 SLC34A2O95436 690 aa25.08■■□□□ 1.61
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