RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623028.1

VGLL4-218, Transcript of vestigial like family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene VGLL4, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4-218ENST00000623028 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.38■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 SASH1O94885 1247 aa23.38■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 SCARF1Q14162 830 aa23.38■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 ATP2B3Q16720 1220 aa23.38■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.38■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.38■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 USP48Q86UV5 1035 aa23.38■■□□□ 1.33
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VGLL4-218ENST00000623028 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.38■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.37■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 VPS37DQ86XT2 251 aa23.37■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 KLRG1Q96E93 195 aa23.37■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.37■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.37■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 FBXO3Q9UK99 471 aa23.37■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 COG6Q9Y2V7 657 aa23.37■■□□□ 1.33
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VGLL4-218ENST00000623028 SLC5A1P13866 664 aa23.36■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 ADORA1P30542 326 aa23.36■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 GRIK5Q16478 980 aa23.36■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 CST9Q5W186 159 aa23.36■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.36■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 LPIN2Q92539 896 aa23.36■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 TFCP2Q12800 502 aa23.35■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.35■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.35■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 OGFOD1Q8N543 542 aa23.35■■□□□ 1.33
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VGLL4-218ENST00000623028 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.34■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
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VGLL4-218ENST00000623028 CELF2O95319 508 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
VGLL4-218ENST00000623028 CNTNAP1P78357 1384 aa23.32■■□□□ 1.32
VGLL4-218ENST00000623028 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
VGLL4-218ENST00000623028 ATP8B2P98198 1209 aa23.32■■□□□ 1.32
VGLL4-218ENST00000623028 CEP85Q6P2H3 762 aa23.32■■□□□ 1.32
VGLL4-218ENST00000623028 SSH3Q8TE77 659 aa23.32■■□□□ 1.32
VGLL4-218ENST00000623028 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.32■■□□□ 1.32
VGLL4-218ENST00000623028 PHKA1P46020 1223 aa23.31■■□□□ 1.32
VGLL4-218ENST00000623028 TIMM10P62072 90 aa23.31■■□□□ 1.32
VGLL4-218ENST00000623028 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
VGLL4-218ENST00000623028 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
VGLL4-218ENST00000623028 SULF1Q8IWU6 871 aa23.3■■□□□ 1.32
VGLL4-218ENST00000623028 PCNTO95613 3336 aa23.29■■□□□ 1.32
VGLL4-218ENST00000623028 A0A1B0GUL7 405 aa23.29■■□□□ 1.32
VGLL4-218ENST00000623028 MS4A1P11836 297 aa23.29■■□□□ 1.32
VGLL4-218ENST00000623028 CFAP100Q494V2 611 aa23.29■■□□□ 1.32
VGLL4-218ENST00000623028 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.29■■□□□ 1.32
VGLL4-218ENST00000623028 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
VGLL4-218ENST00000623028 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
VGLL4-218ENST00000623028 CDCA5Q96FF9 252 aa23.28■■□□□ 1.32
VGLL4-218ENST00000623028 DLGAP5Q15398 846 aa23.27■■□□□ 1.32
VGLL4-218ENST00000623028 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.27■■□□□ 1.32
VGLL4-218ENST00000623028 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.27■■□□□ 1.32
VGLL4-218ENST00000623028 CLRN2A0PK11 232 aa23.26■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 RASSF10A6NK89 507 aa23.26■■□□□ 1.31
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VGLL4-218ENST00000623028 VEGFBP49765 207 aa23.26■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.314e-6■■□□□ 12.4
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VGLL4-218ENST00000623028 JMYQ8N9B5 988 aa23.26■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 XAGE2Q96GT9 111 aa23.26■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.26■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.25■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 SPDYE6P0CI01 402 aa23.25■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.25■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.25■■□□□ 1.31
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VGLL4-218ENST00000623028 GRM1Q13255 1194 aa23.24■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 DEFB115Q30KQ5 88 aa23.24■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 SAPCD2Q86UD0 394 aa23.24■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.24■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.24■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 CRKP46108 304 aa23.23■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 RASGRF1Q13972 1273 aa23.23■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 PDE3AQ14432 1141 aa23.23■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 CYP4F22Q6NT55 531 aa23.23■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.23■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.23■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.23■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.22■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 MMP14P50281 582 aa23.22■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.22■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 PRDX5P30044 214 aa23.21■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 PI16Q6UXB8 463 aa23.21■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 MOB2Q70IA6 237 aa23.21■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
VGLL4-218ENST00000623028 VEZTQ9HBM0 779 aa23.21■■□□□ 1.31
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