RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, human

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRD4-208	ENST00000597315	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	33.47	■■■□□ 2.95
BRD4-208	ENST00000597315	MTX1	Q13505	466 aa		33.47	■■■□□ 2.95
BRD4-208	ENST00000597315	LPIN2	Q92539	896 aa		33.47	■■■□□ 2.95
BRD4-208	ENST00000597315	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		33.47	■■■□□ 2.95
BRD4-208	ENST00000597315	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
BRD4-208	ENST00000597315	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		33.45	■■■□□ 2.95
BRD4-208	ENST00000597315		F8W031	263 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		33.44	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	RLBP1	P12271	317 aa		33.43	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	FGFR2	P21802	821 aa		33.43	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	ATP2B3	Q16720	1220 aa		33.43	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		33.43	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		33.43	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		33.43	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	CNTNAP1	P78357	1384 aa		33.43	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	BCAM	P50895	628 aa		33.42	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	CST9	Q5W186	159 aa		33.42	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	CERS5	Q8N5B7	392 aa		33.42	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	ADM5	C9JUS6	153 aa		33.41	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	DLGAP5	Q15398	846 aa		33.41	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		33.41	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	JMY	Q8N9B5	988 aa		33.41	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		33.41	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	WNT10B	O00744	389 aa		33.4	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	PANK1	Q8TE04	598 aa		33.4	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	RASSF10	A6NK89	507 aa		33.39	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	33.39	■■■□□ 2.94	2e-6	■■□□□ 12.1
BRD4-208	ENST00000597315	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	33.39	■■■□□ 2.94	3e-7	■□□□□ 8.5
BRD4-208	ENST00000597315	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		33.39	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
BRD4-208	ENST00000597315	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
BRD4-208	ENST00000597315	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
BRD4-208	ENST00000597315	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		33.38	■■■□□ 2.93
BRD4-208	ENST00000597315	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		33.37	■■■□□ 2.93
BRD4-208	ENST00000597315	MYO1B	O43795	1136 aa		33.37	■■■□□ 2.93
BRD4-208	ENST00000597315	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		33.37	■■■□□ 2.93
BRD4-208	ENST00000597315	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		33.37	■■■□□ 2.93
BRD4-208	ENST00000597315	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
BRD4-208	ENST00000597315	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
BRD4-208	ENST00000597315	CFAP100	Q494V2	611 aa		33.35	■■■□□ 2.93
BRD4-208	ENST00000597315	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		33.35	■■■□□ 2.93
BRD4-208	ENST00000597315	ECE1	P42892	770 aa		33.34	■■■□□ 2.93
BRD4-208	ENST00000597315	VEGFB	P49765	207 aa		33.34	■■■□□ 2.93
BRD4-208	ENST00000597315	ATP8B2	P98198	1209 aa		33.34	■■■□□ 2.93
BRD4-208	ENST00000597315	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
BRD4-208	ENST00000597315	DLK2	Q6UY11	383 aa		33.34	■■■□□ 2.93
BRD4-208	ENST00000597315	TFCP2	Q12800	502 aa		33.33	■■■□□ 2.93
BRD4-208	ENST00000597315	GRM1	Q13255	1194 aa		33.33	■■■□□ 2.93
BRD4-208	ENST00000597315	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
BRD4-208	ENST00000597315	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		33.33	■■■□□ 2.93
BRD4-208	ENST00000597315	CDCA5	Q96FF9	252 aa		33.33	■■■□□ 2.93
BRD4-208	ENST00000597315	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
BRD4-208	ENST00000597315	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		33.32	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		33.31	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		33.3	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		33.3	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	NF2	P35240	595 aa		33.29	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	HUNK	P57058	714 aa		33.29	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	POLA2	Q14181	598 aa		33.29	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	SSH3	Q8TE77	659 aa		33.29	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		33.29	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	COG6	Q9Y2V7	657 aa		33.29	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315		A0A1B0GUL7	405 aa		33.28	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		33.28	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	SPDYE6	P0CI01	402 aa		33.28	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	TIMM10	P62072	90 aa		33.28	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	GORAB	Q5T7V8	394 aa		33.28	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	CAPNS2	Q96L46	248 aa		33.28	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	MAST3	O60307	1309 aa		33.28	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		33.27	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		33.27	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		33.27	■■■□□ 2.92
BRD4-208	ENST00000597315	SEMA3E	O15041	775 aa		33.26	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		33.26	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	VEZT	Q9HBM0	779 aa		33.26	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	ADORA1	P30542	326 aa		33.25	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	PHKA1	P46020	1223 aa		33.25	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	CCDC102B	Q68D86	513 aa		33.25	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		33.25	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	CLRN2	A0PK11	232 aa		33.24	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	CRK	P46108	304 aa		33.24	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	TEKT1	Q969V4	418 aa		33.24	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	XAGE2	Q96GT9	111 aa		33.24	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		33.24	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
BRD4-208	ENST00000597315	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		33.23	■■■□□ 2.91

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