RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 APAF1O14727 1248 aa20.65■□□□□ 0.9
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PTPRS-208ENST00000590509 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
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PTPRS-208ENST00000590509 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
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PTPRS-208ENST00000590509 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.48■□□□□ 0.87
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PTPRS-208ENST00000590509 CACNB3P54284 484 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.47■□□□□ 0.87
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