RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589253.1

TOMM40-204, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

TSL 3

Gene TOMM40, Length 207 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-204ENST00000589253 ALDH1A1P00352 501 aa14.66□□□□□ -0.06
TOMM40-204ENST00000589253 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TOMM40-204ENST00000589253 MMP14P50281 582 aa14.66□□□□□ -0.06
TOMM40-204ENST00000589253 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.66□□□□□ -0.06
TOMM40-204ENST00000589253 USP44Q9H0E7 712 aa14.66□□□□□ -0.06
TOMM40-204ENST00000589253 MED23Q9ULK4 1368 aa14.65□□□□□ -0.06
TOMM40-204ENST00000589253 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TOMM40-204ENST00000589253 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.65□□□□□ -0.06
TOMM40-204ENST00000589253 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.65□□□□□ -0.06
TOMM40-204ENST00000589253 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TOMM40-204ENST00000589253 PANK1Q8TE04 598 aa14.65□□□□□ -0.06
TOMM40-204ENST00000589253 KAZALD1Q96I82 304 aa14.65□□□□□ -0.06
TOMM40-204ENST00000589253 SUCLG2Q96I99 432 aa14.65□□□□□ -0.06
TOMM40-204ENST00000589253 PLA2G12BQ9BX93 195 aa14.65□□□□□ -0.06
TOMM40-204ENST00000589253 C20orf194Q5TEA3 1177 aa14.64□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 WNT10BO00744 389 aa14.63□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 CTSWP56202 376 aa14.63□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 PRKG1Q13976 671 aa14.63□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.63□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 MEIS3Q99687 375 aa14.63□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 CFHR5Q9BXR6 569 aa14.63□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 COA1Q9GZY4 146 aa14.63□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 SASH1O94885 1247 aa14.62□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 FOXO4P98177 505 aa14.62□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 DACT2Q5SW24 774 aa14.62□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 RRP1P56182 461 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 INHBEP58166 350 aa14.61□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.61□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.61□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 MXD3Q9BW11 206 aa14.61□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 TRIM17Q9Y577 477 aa14.61□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 CSF1RP07333 972 aa14.6□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 SPRYD7Q5W111 196 aa14.6□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.6□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 SLC10A4Q96EP9 437 aa14.6□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 GREM2Q9H772 168 aa14.6□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.6□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.6□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 KCNJ4P48050 445 aa14.59□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.59□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.59□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 ITPRIPQ8IWB1 547 aa14.59□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TOMM40-204ENST00000589253 MYO1BO43795 1136 aa14.58□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 IFNL1Q8IU54 200 aa14.58□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 ERO1AQ96HE7 468 aa14.58□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 MPHOSPH8Q99549 860 aa14.58□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.58□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 COG6Q9Y2V7 657 aa14.58□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 PDE3AQ14432 1141 aa14.57□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 DLGAP5Q15398 846 aa14.57□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 LDLRAD1Q5T700 205 aa14.57□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.57□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.57□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.57□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 GTF2IP78347 998 aa14.56□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.56□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.56□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa14.56□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.56□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 UNCXA6NJT0 531 aa14.55□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 GNAI3P08754 354 aa14.55□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 ITGA6P23229 1130 aa14.55□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.55□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 WNK4Q96J92 1243 aa14.55□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 POTEFA5A3E0 1075 aa14.54□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 MS4A1P11836 297 aa14.54□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 ARHGEF6Q15052 776 aa14.54□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.54□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 MAP3K11Q16584 847 aa14.53□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.53□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 EFCC1Q9HA90 598 aa14.53□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 VEZTQ9HBM0 779 aa14.53□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 FZD1Q9UP38 647 aa14.53□□□□□ -0.08
TOMM40-204ENST00000589253 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms