RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
PPP4C-212ENST00000567828 MYH13Q9UKX3 1938 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP4C-212ENST00000567828 UBE4AQ14139 1066 aa28.57■■■□□ 2.16
PPP4C-212ENST00000567828 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa28.57■■■□□ 2.16
PPP4C-212ENST00000567828 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
PPP4C-212ENST00000567828 MROH5Q6ZUA9 1318 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP4C-212ENST00000567828 F8W031 263 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
PPP4C-212ENST00000567828 GYG1P46976 350 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP4C-212ENST00000567828 LRRC24Q50LG9 513 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC102AQ96A19 550 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP4C-212ENST00000567828 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
PPP4C-212ENST00000567828 MOB2Q70IA6 237 aa28.54■■■□□ 2.16
PPP4C-212ENST00000567828 KLHDC4Q8TBB5 520 aa28.54■■■□□ 2.16
PPP4C-212ENST00000567828 CA12O43570 354 aa28.53■■■□□ 2.16
PPP4C-212ENST00000567828 SLC10A3P09131 477 aa28.53■■■□□ 2.16
PPP4C-212ENST00000567828 FKBP1BP68106 108 aa28.53■■■□□ 2.16
PPP4C-212ENST00000567828 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa28.53■■■□□ 2.16
PPP4C-212ENST00000567828 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
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PPP4C-212ENST00000567828 METTL24Q5JXM2 366 aa28.52■■■□□ 2.16
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PPP4C-212ENST00000567828 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
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PPP4C-212ENST00000567828 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
PPP4C-212ENST00000567828 RASAL3Q86YV0 1011 aa28.51■■■□□ 2.15
PPP4C-212ENST00000567828 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
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PPP4C-212ENST00000567828 UBE2Q2LH0YL09 131 aa28.49■■■□□ 2.15
PPP4C-212ENST00000567828 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
PPP4C-212ENST00000567828 CFAP100Q494V2 611 aa28.49■■■□□ 2.15
PPP4C-212ENST00000567828 VGLL2Q8N8G2 317 aa28.49■■■□□ 2.15
PPP4C-212ENST00000567828 MTMR14Q8NCE2 650 aa28.49■■■□□ 2.15
PPP4C-212ENST00000567828 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
PPP4C-212ENST00000567828 NF2P35240 595 aa28.48■■■□□ 2.15
PPP4C-212ENST00000567828 MFSD14BQ5SR56 506 aa28.47■■■□□ 2.15
PPP4C-212ENST00000567828 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
PPP4C-212ENST00000567828 AOX1Q06278 1338 aa28.46■■■□□ 2.15
PPP4C-212ENST00000567828 SPDYE2BA6NHP3 402 aa28.46■■■□□ 2.15
PPP4C-212ENST00000567828 PDE8BO95263 885 aa28.46■■■□□ 2.15
PPP4C-212ENST00000567828 SPDYE6P0CI01 402 aa28.46■■■□□ 2.15
PPP4C-212ENST00000567828 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
PPP4C-212ENST00000567828 RARSP54136 660 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
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PPP4C-212ENST00000567828 CLRN2A0PK11 232 aa28.45■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 PRKG1Q13976 671 aa28.45■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 FBXO33Q7Z6M2 555 aa28.45■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 VPS37DQ86XT2 251 aa28.45■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 DEFB129Q9H1M3 183 aa28.44■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 MYO1BO43795 1136 aa28.43■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 CSRNP1Q96S65 589 aa28.43■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
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PPP4C-212ENST00000567828 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
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PPP4C-212ENST00000567828 FZD1Q9UP38 647 aa28.42■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 KIF16BQ96L93 1317 aa28.42■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 OTOFQ9HC10 1997 aa28.41■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 EYA2O00167 538 aa28.41■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 RNF186Q9NXI6 227 aa28.41■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 SAGE1Q9NXZ1 904 aa28.41■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 TRPA1O75762 1119 aa28.4■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 BCAMP50895 628 aa28.4■■■□□ 2.14
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PPP4C-212ENST00000567828 GRIK5Q16478 980 aa28.4■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 ARMC9Q7Z3E5 817 aa28.4■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 ABHD8Q96I13 439 aa28.4■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 FGFR2P21802 821 aa28.39■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 ATG9AQ7Z3C6 839 aa28.39■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 MIER1Q8N108 512 aa28.39■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 MEIS3Q99687 375 aa28.39■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 SIL1Q9H173 461 aa28.39■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
PPP4C-212ENST00000567828 LAMB1P07942 1786 aa28.38■■■□□ 2.13
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PPP4C-212ENST00000567828 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
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PPP4C-212ENST00000567828 SPDYE2Q495Y8 402 aa28.35■■■□□ 2.13
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PPP4C-212ENST00000567828 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
PPP4C-212ENST00000567828 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
PPP4C-212ENST00000567828 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa28.35■■■□□ 2.13
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
PPP4C-212ENST00000567828 RASA3Q14644 834 aa28.34■■■□□ 2.13
PPP4C-212ENST00000567828 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
PPP4C-212ENST00000567828 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
PPP4C-212ENST00000567828 LPIN2Q92539 896 aa28.34■■■□□ 2.13
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