RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563386.5

USP10-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 590 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-208ENST00000563386 FBXO3Q9UK99 471 aa23.51■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 SASH1O94885 1247 aa23.5■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 SLC5A1P13866 664 aa23.5■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 BCAMP50895 628 aa23.5■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 MTX1Q13505 466 aa23.5■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.5■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.5■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 ADM5C9JUS6 153 aa23.49■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 CELF2O95319 508 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 MS4A1P11836 297 aa23.49■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 FGFR2P21802 821 aa23.49■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 ATP2B3Q16720 1220 aa23.49■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 LPIN2Q92539 896 aa23.49■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.48■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.48■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 SULF1Q8IWU6 871 aa23.48■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 CST9Q5W186 159 aa23.47■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.47■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.46■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.45■■□□□ 1.35
USP10-208ENST00000563386 TFCP2Q12800 502 aa23.45■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 WNT10BO00744 389 aa23.44■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.341e-6■■□□□ 13.5
USP10-208ENST00000563386 DLGAP5Q15398 846 aa23.44■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 COG6Q9Y2V7 657 aa23.44■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 MMP14P50281 582 aa23.43■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 ATP8B2P98198 1209 aa23.43■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 CNTNAP1P78357 1384 aa23.42■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 GRM1Q13255 1194 aa23.42■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 DEFB115Q30KQ5 88 aa23.42■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.42■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 ADORA1P30542 326 aa23.41■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 TIMM10P62072 90 aa23.41■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 CFAP100Q494V2 611 aa23.41■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 VEGFBP49765 207 aa23.4■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 POLA2Q14181 598 aa23.4■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 CDCA5Q96FF9 252 aa23.4■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.4■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.4■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.39■■□□□ 1.34
USP10-208ENST00000563386 RASSF10A6NK89 507 aa23.39■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 GRIK5Q16478 980 aa23.39■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.39■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 JMYQ8N9B5 988 aa23.39■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 SSH3Q8TE77 659 aa23.39■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.39■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.39■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 A0A1B0GUL7 405 aa23.38■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 PHKA1P46020 1223 aa23.38■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.38■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.38■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 CLRN2A0PK11 232 aa23.37■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 GORABQ5T7V8 394 aa23.37■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.37■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.36■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 MYO1BO43795 1136 aa23.36■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 SPDYE6P0CI01 402 aa23.36■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 CCDC102BQ68D86 513 aa23.36■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 CEP85Q6P2H3 762 aa23.36■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 SAPCD2Q86UD0 394 aa23.36■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.36■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 XAGE2Q96GT9 111 aa23.36■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.35■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 HUNKP57058 714 aa23.35■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 CYP4F22Q6NT55 531 aa23.35■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.35■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 CAPNS2Q96L46 248 aa23.35■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 VEZTQ9HBM0 779 aa23.35■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.35■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 AOX1Q06278 1338 aa23.34■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 CRKP46108 304 aa23.34■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.34■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 PDE3AQ14432 1141 aa23.33■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.33■■□□□ 1.33
USP10-208ENST00000563386 ECE1P42892 770 aa23.32■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
USP10-208ENST00000563386 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 194.8 ms