RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	27.28	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	METTL24	Q5JXM2	366 aa		27.28	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		27.28	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	BCAR3	O75815	825 aa		27.27	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP2K2	P36507	400 aa		27.27	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	GRM1	Q13255	1194 aa		27.27	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	27.27	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	AOC2	O75106	756 aa		27.26	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		27.26	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		27.26	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	MEIS3	Q99687	375 aa		27.26	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	JAG2	Q9Y219	1238 aa		27.26	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	EYA2	O00167	538 aa		27.25	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM27	P14373	513 aa		27.25	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		27.25	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	AIDA	Q96BJ3	306 aa		27.25	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	27.25	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	27.24	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	FGFR2	P21802	821 aa		27.24	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		27.24	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		27.23	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	27.23	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		27.23	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		27.23	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		27.23	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	TNN	Q9UQP3	1299 aa		27.23	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	27.22	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	RGMB	Q6NW40	437 aa		27.22	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXO3	Q9UK99	471 aa		27.22	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		27.22	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		27.21	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200		F8W031	263 aa	Predicted RBP	27.21	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	FKBP1B	P68106	108 aa		27.21	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	27.21	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	DLGAP5	Q15398	846 aa		27.21	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		27.21	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		27.21	■■□□□ 1.95
PPP4C-205	ENST00000563200	CIAO1	O76071	339 aa		27.2	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		27.2	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		27.2	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	ZIC5	Q96T25	663 aa		27.2	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	NOG	Q13253	232 aa		27.19	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		27.19	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	27.19	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	27.19	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		27.18	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	SPDYE6	P0CI01	402 aa		27.18	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	27.18	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	BCAM	P50895	628 aa		27.18	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	CFAP100	Q494V2	611 aa		27.18	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	VPS37D	Q86XT2	251 aa		27.18	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	27.18	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	GNAI3	P08754	354 aa		27.17	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	SIL1	Q9H173	461 aa		27.17	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	COPRS	Q9NQ92	184 aa		27.17	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	27.17	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	27.16	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	27.16	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	LBX1	P52954	281 aa		27.16	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	MTX1	Q13505	466 aa		27.16	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	LPIN2	Q92539	896 aa		27.16	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC102A	Q96A19	550 aa		27.16	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	AOX1	Q06278	1338 aa		27.16	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	27.16	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	27.16	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	27.15	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	GRIK5	Q16478	980 aa		27.15	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		27.15	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	MOB2	Q70IA6	237 aa		27.15	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	TNS4	Q8IZW8	715 aa		27.15	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		27.15	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		27.15	■■□□□ 1.94
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC10A3	P09131	477 aa		27.14	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		27.14	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		27.14	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC5A1	P13866	664 aa		27.13	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	27.13	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		27.13	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		27.12	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		27.11	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	CLRN2	A0PK11	232 aa		27.11	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	MYO1B	O43795	1136 aa		27.11	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	27.11	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		27.11	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		27.11	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		27.1	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	SRGAP3	O43295	1099 aa		27.1	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	CA12	O43570	354 aa		27.1	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	27.1	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	NF2	P35240	595 aa		27.1	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	27.1	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		27.1	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	GNAI2	P04899	355 aa		27.09	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	27.09	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP2B3	Q16720	1220 aa		27.09	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		27.09	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	CRK	P46108	304 aa		27.08	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	27.08	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	27.08	■■□□□ 1.93
PPP4C-205	ENST00000563200	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		27.08	■■□□□ 1.93

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