RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560777.5

RABGGTA-218, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGGTA, Length 1,197 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-218ENST00000560777 MICALL2Q8IY33 904 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-218ENST00000560777 KIF1BPQ96EK5 621 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-218ENST00000560777 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-218ENST00000560777 H7C1D1 291 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-218ENST00000560777 ZBTB22O15209 634 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-218ENST00000560777 TOMM70O94826 608 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-218ENST00000560777 POTEIP0CG38 1075 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-218ENST00000560777 POTEJP0CG39 1038 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-218ENST00000560777 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-218ENST00000560777 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-218ENST00000560777 DBNDD2Q9BQY9 259 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-218ENST00000560777 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-218ENST00000560777 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-218ENST00000560777 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-218ENST00000560777 ZNF609O15014 1411 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-218ENST00000560777 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 EGFRP00533 1210 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 USP17L8P0C7I0 530 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 GORABQ5T7V8 394 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 SAMD7Q7Z3H4 446 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 SEMA3EO15041 775 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 GRIK5Q16478 980 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 AACSQ86V21 672 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 RASGRF1Q13972 1273 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 OGFOD1Q8N543 542 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 TRPM4Q8TD43 1214 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 F8W031 263 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 IGHDP01880 384 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 MMP14P50281 582 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 SCARF1Q14162 830 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 LDHDQ86WU2 507 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 WDR66Q8TBY9 1149 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 MCAMP43121 646 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 CHADLQ6NUI6 762 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 BCL11AQ9H165 835 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 PGAP2Q9UHJ9 254 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 PI16Q6UXB8 463 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 SPATA5Q8NB90 893 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 SMC1BQ8NDV3 1235 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-218ENST00000560777 C1QTNF8P60827 252 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-218ENST00000560777 FSTL1Q12841 308 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-218ENST00000560777 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-218ENST00000560777 GCC1Q96CN9 775 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-218ENST00000560777 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-218ENST00000560777 SNRKQ9NRH2 765 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-218ENST00000560777 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-218ENST00000560777 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-218ENST00000560777 WNT10BO00744 389 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-218ENST00000560777 PRDX5P30044 214 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-218ENST00000560777 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-218ENST00000560777 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-218ENST00000560777 SMC5Q8IY18 1101 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-218ENST00000560777 CNTROBQ8N137 903 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-218ENST00000560777 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-218ENST00000560777 MRIQ9BWK5 157 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-218ENST00000560777 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-218ENST00000560777 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-218ENST00000560777 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-218ENST00000560777 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-218ENST00000560777 DLGAP5Q15398 846 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88 ms