RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559322.5

SEMA4B-211, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 4

Gene SEMA4B, Length 559 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-211ENST00000559322 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SEMA4B-211ENST00000559322 F8W031 263 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SEMA4B-211ENST00000559322 CHRDL2Q6WN34 429 aa24.81■■□□□ 1.56
SEMA4B-211ENST00000559322 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.81■■□□□ 1.56
SEMA4B-211ENST00000559322 OTUD5Q96G74 571 aa24.81■■□□□ 1.56
SEMA4B-211ENST00000559322 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.81■■□□□ 1.56
SEMA4B-211ENST00000559322 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SEMA4B-211ENST00000559322 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SEMA4B-211ENST00000559322 CFAP100Q494V2 611 aa24.8■■□□□ 1.56
SEMA4B-211ENST00000559322 OPTNQ96CV9 577 aa24.8■■□□□ 1.56
SEMA4B-211ENST00000559322 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.8■■□□□ 1.56
SEMA4B-211ENST00000559322 ELP3Q9H9T3 547 aa24.8■■□□□ 1.56
SEMA4B-211ENST00000559322 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.8■■□□□ 1.56
SEMA4B-211ENST00000559322 CD209Q9NNX6 404 aa24.8■■□□□ 1.56
SEMA4B-211ENST00000559322 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa24.8■■□□□ 1.56
SEMA4B-211ENST00000559322 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.78■■□□□ 1.56
SEMA4B-211ENST00000559322 CERS5Q8N5B7 392 aa24.78■■□□□ 1.56
SEMA4B-211ENST00000559322 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.77■■□□□ 1.56
SEMA4B-211ENST00000559322 DLL1O00548 723 aa24.77■■□□□ 1.56
SEMA4B-211ENST00000559322 SPDYE6P0CI01 402 aa24.77■■□□□ 1.56
SEMA4B-211ENST00000559322 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
SEMA4B-211ENST00000559322 RASA3Q14644 834 aa24.77■■□□□ 1.56
SEMA4B-211ENST00000559322 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SEMA4B-211ENST00000559322 IGKV5-2P06315 115 aa24.76■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 RALBP1Q15311 655 aa24.76■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 SH3TC2Q8TF17 1288 aa24.76■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 DPF3Q92784 378 aa24.76■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.75■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 ITGA6P23229 1130 aa24.75■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 KIF22Q14807 665 aa24.75■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 CCL15Q16663 113 aa24.75■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.75■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.75■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 MS4A4AQ96JQ5 239 aa24.75■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.75■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 ECM29Q5VYK3 1845 aa24.75■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 MYH3P11055 1940 aa24.74■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.74■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 GTF2A2P52657 109 aa24.74■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 KSR2Q6VAB6 950 aa24.74■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.74■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.74■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.74■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 CHRNDQ07001 517 aa24.73■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 TNFAIP1Q13829 316 aa24.73■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF853P0CG23 659 aa24.72■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 IFT57Q9NWB7 429 aa24.72■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 AOX1Q06278 1338 aa24.71■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 GNAI1P63096 354 aa24.71■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.71■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.71■■□□□ 1.55
SEMA4B-211ENST00000559322 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.7■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.7■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 JAG2Q9Y219 1238 aa24.7■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 H7C1W4 665 aa24.69■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 TAF5LO75529 589 aa24.69■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.69■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.69■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 CSADQ9Y600 493 aa24.69■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 SZT2Q5T011 3432 aa24.69■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 OTOFQ9HC10 1997 aa24.69■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 SNAP23O00161 211 aa24.68■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 IL1R1P14778 569 aa24.68■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 VGLL4Q14135 290 aa24.68■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa24.68■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 TLR2O60603 784 aa24.67■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 GNRH1P01148 92 aa24.67■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 MAP3K9P80192 1104 aa24.67■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.67■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.67■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.66■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 PRMT2P55345 433 aa24.66■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 SPDYE2Q495Y8 402 aa24.66■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 HTATIP2Q9BUP3 242 aa24.66■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.65■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.65■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 STK31Q9BXU1 1019 aa24.65■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 CETPP11597 493 aa24.64■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 TNNI2P48788 182 aa24.64■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 MTFR1Q15390 333 aa24.64■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP24.64■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 SHISA4Q96DD7 197 aa24.64■■□□□ 1.54
SEMA4B-211ENST00000559322 TCP10L2B9ZVM9 353 aa24.63■■□□□ 1.53
SEMA4B-211ENST00000559322 CSF1RP07333 972 aa24.63■■□□□ 1.53
SEMA4B-211ENST00000559322 CDAN1Q8IWY9 1227 aa24.63■■□□□ 1.53
SEMA4B-211ENST00000559322 TEPSINQ96N21 525 aa24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms