RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 WDR63Q8IWG1 891 aa21.6■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.6■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 MRS2Q9HD23 443 aa21.6■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.6■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 MYO1BO43795 1136 aa21.59■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 PLIN1O60240 522 aa21.59■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 CFAP100Q494V2 611 aa21.59■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.59■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 BEND3Q5T5X7 828 aa21.59■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.59■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.59■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 FKTNO75072 461 aa21.58■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 IL1R1P14778 569 aa21.58■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.58■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.58■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 JAG2Q9Y219 1238 aa21.58■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 CLRN2A0PK11 232 aa21.57■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.57■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 CFHR5Q9BXR6 569 aa21.57■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 VEZTQ9HBM0 779 aa21.57■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.57■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.57■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 ALDH1A1P00352 501 aa21.56■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 MAP3K11Q16584 847 aa21.56■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.56■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa21.55■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.55■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 SPDYE6P0CI01 402 aa21.55■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 INHBEP58166 350 aa21.55■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.55■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.55■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 A0A1B0GUL6 1792 aa21.54■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 GRM8O00222 908 aa21.54■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 WNK4Q96J92 1243 aa21.54■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.53■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 IFNL1Q8IU54 200 aa21.53■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.53■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.52■■□□□ 1.04
CS-214ENST00000548849 AOX1Q06278 1338 aa21.52■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 ANP32CO43423 234 aa21.51■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 RASA3Q14644 834 aa21.51■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 UNCXA6NJT0 531 aa21.5■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.5■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 TRIM17Q9Y577 477 aa21.5■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.5■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.032e-6■□□□□ 11
CS-214ENST00000548849 ALDH1L1O75891 902 aa21.49■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 GYG1P46976 350 aa21.49■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 UBE4AQ14139 1066 aa21.49■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.49■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 TNFAIP1Q13829 316 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 SUCLG2Q96I99 432 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 GJA5P36382 358 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-214ENST00000548849 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 ELP3Q9H9T3 547 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.44■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 CRKP46108 304 aa21.44■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 CRHR2Q13324 411 aa21.44■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 VPS37DQ86XT2 251 aa21.44■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.44■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 OPTNQ96CV9 577 aa21.44■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 ERO1AQ96HE7 468 aa21.44■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 KAZALD1Q96I82 304 aa21.44■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.44■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.43■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 PTPN18Q99952 460 aa21.43■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.43■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.43■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
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