RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545825.1

CCDC189-211, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC189, Length 1,046 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-211ENST00000545825 TMEM88BA6NKF7 163 aa27.94■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 MMP14P50281 582 aa27.94■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 ATP2B3Q16720 1220 aa27.94■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 CDC37L1Q7L3B6 337 aa27.94■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 ATP8B2P98198 1209 aa27.93■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 SCARF1Q14162 830 aa27.93■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 POLA2Q14181 598 aa27.93■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 MVPQ14764 893 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 SSH3Q8TE77 659 aa27.92■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 GGA3Q9NZ52 723 aa27.92■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 USP48Q86UV5 1035 aa27.91■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 KLRG1Q96E93 195 aa27.91■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 HDAC9Q9UKV0 1011 aa27.91■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 COG6Q9Y2V7 657 aa27.91■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 NBPF9Q3BBW0 867 aa27.9■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 MFSD14BQ5SR56 506 aa27.9■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 CST9Q5W186 159 aa27.9■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 KRT26Q7Z3Y9 468 aa27.9■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 WNT10BO00744 389 aa27.89■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 TFCP2Q12800 502 aa27.89■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 DLK2Q6UY11 383 aa27.89■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
CCDC189-211ENST00000545825 ADM5C9JUS6 153 aa27.88■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 F8W031 263 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 C20orf194Q5TEA3 1177 aa27.88■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 DDX19BQ9UMR2 479 aa27.88■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 PDE3AQ14432 1141 aa27.87■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 CEP85Q6P2H3 762 aa27.87■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 TRPM7Q96QT4 1865 aa27.87■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 ARAP2Q8WZ64 1704 aa27.87■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 ADORA1P30542 326 aa27.86■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 SULF1Q8IWU6 871 aa27.86■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa27.86■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 CELF2O95319 508 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 TIMM10P62072 90 aa27.85■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa27.85■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 AKAP2Q9Y2D5 859 aa27.85■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 A0A1B0GUL7 405 aa27.84■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 GRIK5Q16478 980 aa27.84■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 MTMR14Q8NCE2 650 aa27.84■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa27.84■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 CNTNAP1P78357 1384 aa27.84■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 PHKA1P46020 1223 aa27.83■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 DLGAP5Q15398 846 aa27.83■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 ZNF408Q9H9D4 720 aa27.83■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa27.83■■■□□ 2.05
CCDC189-211ENST00000545825 SURF6O75683 361 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 CFAP100Q494V2 611 aa27.82■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 RASSF10A6NK89 507 aa27.81■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 CCDC102BQ68D86 513 aa27.81■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 JMYQ8N9B5 988 aa27.81■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 XAGE2Q96GT9 111 aa27.81■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 SPDYE2BA6NHP3 402 aa27.8■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 SPDYE6P0CI01 402 aa27.8■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 TLL2Q9Y6L7 1015 aa27.8■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 ZBTB22O15209 634 aa27.79■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 CDCA5Q96FF9 252 aa27.79■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 NEUROD6Q96NK8 337 aa27.79■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 SERPINA10Q9UK55 444 aa27.79■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 AOX1Q06278 1338 aa27.78■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 SEMA3EO15041 775 aa27.78■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 WDR66Q8TBY9 1149 aa27.78■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 MYH13Q9UKX3 1938 aa27.78■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP27.77■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 DEFB115Q30KQ5 88 aa27.77■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 SAPCD2Q86UD0 394 aa27.77■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 DENND2AQ9ULE3 1009 aa27.77■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa27.77■■■□□ 2.04
CCDC189-211ENST00000545825 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
CCDC189-211ENST00000545825 SIRT2Q8IXJ6 389 aa27.76■■■□□ 2.03
CCDC189-211ENST00000545825 GPR108Q9NPR9 543 aa27.76■■■□□ 2.03
CCDC189-211ENST00000545825 CRKP46108 304 aa27.75■■■□□ 2.03
CCDC189-211ENST00000545825 VEGFBP49765 207 aa27.75■■■□□ 2.03
CCDC189-211ENST00000545825 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
CCDC189-211ENST00000545825 RASGRF1Q13972 1273 aa27.75■■■□□ 2.03
CCDC189-211ENST00000545825 MYO1BO43795 1136 aa27.74■■■□□ 2.03
CCDC189-211ENST00000545825 TNNI3KQ59H18 835 aa27.74■■■□□ 2.03
CCDC189-211ENST00000545825 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
CCDC189-211ENST00000545825 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa27.74■■■□□ 2.03
CCDC189-211ENST00000545825 ECM29Q5VYK3 1845 aa27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms