RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537007.5

MRPL48-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L48, human

TSL 3

Gene MRPL48, Length 287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	ARX	Q96QS3	562 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	UTRN	P46939	3433 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	MED26	O95402	600 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	GHRH	P01286	108 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	GPLD1	P80108	840 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	RNF43	Q68DV7	783 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	OGFOD2	Q6N063	350 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	WWC1	Q8IX03	1113 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	IL27	Q8NEV9	243 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	FAM177B	A6PVY3	158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	C8A	P07357	584 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	RARA	P10276	462 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	ABL2	P42684	1182 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	GGT6	Q6P531	493 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007		Q6ZS46	218 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	MSH6	P52701	1360 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	UNC13B	O14795	1591 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007		M0R2N6	131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	NRL	P54845	237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	NCOA4	Q13772	614 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	GRIK5	Q16478	980 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	C14orf37	Q86TY3	774 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	ATRN	O75882	1429 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	NLRP1	Q9C000	1473 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	IRF5	Q13568	498 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	NEUROD2	Q15784	382 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	PKN1	Q16512	942 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	CCDC102B	Q68D86	513 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	PLD4	Q96BZ4	506 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	FBXL18	Q96ME1	805 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	ATG3	Q9NT62	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	PLXNC1	O60486	1568 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	ABCC3	O15438	1527 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	PSAP	P07602	524 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	PZP	P20742	1482 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	ARSD	P51689	593 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	RTN1	Q16799	776 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL48-208	ENST00000537007	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL48-208	ENST00000537007	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL48-208	ENST00000537007	MIA2	Q96PC5	1412 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL48-208	ENST00000537007	HSPA6	P17066	643 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL48-208	ENST00000537007	KCNA6	P17658	529 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL48-208	ENST00000537007	LTK	P29376	864 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL48-208	ENST00000537007	PLAUR	Q03405	335 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL48-208	ENST00000537007	ACAD11	Q709F0	780 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL48-208	ENST00000537007	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL48-208	ENST00000537007	PPME1	Q9Y570	386 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL48-208	ENST00000537007	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL48-208	ENST00000537007	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL48-208	ENST00000537007	USP17L5	A8MUK1	530 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL48-208	ENST00000537007	SETDB1	Q15047	1291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL48-208	ENST00000537007	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL48-208	ENST00000537007	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL48-208	ENST00000537007	ABI1	Q8IZP0	508 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL48-208	ENST00000537007	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL48-208	ENST00000537007	MYRFL	Q96LU7	910 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL48-208	ENST00000537007	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL48-208	ENST00000537007	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL48-208	ENST00000537007	PIM2	Q9P1W9	311 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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