RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	PIEZO1	Q92508	2521 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	GYS1	P13807	737 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	PDE4C	Q08493	712 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	USP4	Q13107	963 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	ARID5B	Q14865	1188 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	TRIM50	Q86XT4	487 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	CNTROB	Q8N137	903 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF428	Q96B54	188 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	CDK19	Q9BWU1	502 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	NOD1	Q9Y239	953 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM196B	A6NMK8	535 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	GDF9	O60383	454 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	FSHR	P23945	695 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	ECE1	P42892	770 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	PRR20E	P86478	221 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	PRR20C	P86479	221 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	PRR20D	P86480	221 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	PRR20B	P86481	221 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	PRR20A	P86496	221 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	DDR1	Q08345	913 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	ITPK1	Q13572	414 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PABPC1-223	ENST00000523636	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	ATP1A2	P50993	1020 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	TMF1	P82094	1093 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	CACNA1S	Q13698	1873 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	ERVK-9	P63128	1117 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	FOXC1	Q12948	553 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	UST	Q9Y2C2	406 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	INSR	P06213	1382 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	TRAF5	O00463	557 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	ALDH1A1	P00352	501 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	CYP4X1	Q8N118	509 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	USP17L15	C9J2P7	530 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	USP17L10	C9JJH3	530 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	USP17L12	C9JPN9	530 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	USP17L11	C9JVI0	530 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	USP17L21	D6R901	530 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	USP17L18	D6R9N7	530 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	USP17L22	D6RA61	530 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	USP17L19	D6RCP7	530 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	USP17L20	D6RJB6	530 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	RASA1	P20936	1047 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	PLA2G5	P39877	138 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	RAB15	P59190	212 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	USP17L24	Q0WX57	530 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	PTK7	Q13308	1070 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	RETREG2	Q8NC44	543 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	ERBB4	Q15303	1308 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	NR3C2	P08235	984 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	GTF2I	P78347	998 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	NNT	Q13423	1086 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	CDCA8	Q53HL2	280 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	OGFOD1	Q8N543	542 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	SNX27	Q96L92	541 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		7.23	□□□□□ -1.25

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