RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519617.1

CCNC-208, Transcript of cyclin C, human

TSL 3

Gene CCNC, Length 246 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNC-208	ENST00000519617	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	ATG3	Q9NT62	314 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	TIAF1	O95411	115 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	PRNP	P04156	253 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	F13B	P05160	661 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	ACPP	P15309	386 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	FOSL1	P15407	271 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	SGO2	Q562F6	1265 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	ABI1	Q8IZP0	508 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	NXPE3	Q969Y0	559 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	CBLL1	Q75N03	491 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	ATCAY	Q86WG3	371 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	BSND	Q8WZ55	320 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	EDEM1	Q92611	657 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	HHIP	Q96QV1	700 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	CHRD	Q9H2X0	955 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	SLAIN2	Q9P270	581 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	TRPA1	O75762	1119 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	PCSK2	P16519	638 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	IKBKE	Q14164	716 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	PAOX	Q6QHF9	649 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	FBXL6	Q8N531	539 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	FBXL18	Q96ME1	805 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	OSMR	Q99650	979 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	SEPT3	Q9UH03	358 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		4	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	DLGAP3	O95886	979 aa		4	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	PDGFA	P04085	211 aa		4	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	RXRB	P28702	533 aa		4	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	NFKBIB	Q15653	356 aa		4	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		4	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	SHISA5	Q8N114	240 aa		4	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		4	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617		A6NHS1	94 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	DRD2	P14416	443 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	ITGB5	P18084	799 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	ATP2B4	P23634	1241 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	ADM	P35318	185 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	USP11	P51784	963 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	COL19A1	Q14993	1142 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	C8orf34	Q49A92	452 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	OGFOD2	Q6N063	350 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	TTC16	Q8NEE8	873 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	ASIC4	Q96FT7	647 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	USP26	Q9BXU7	913 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	EREG	O14944	169 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	CYP26A1	O43174	497 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	EDN3	P14138	238 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	JAG1	P78504	1218 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	ZAR1	Q86SH2	424 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	GATA6	Q92908	595 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	TNFRSF21	O75509	655 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CCNC-208	ENST00000519617	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		3.97	□□□□□ -1.77

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