RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.7□□□□□ -1.02
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 XKR5Q6UX68 686 aa8.69□□□□□ -1.02
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KANSL3Q9P2N6 904 aa8.63□□□□□ -1.03
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM129BQ96TA1 746 aa8.58□□□□□ -1.04
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TIAF1O95411 115 aa8.57□□□□□ -1.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CES1P23141 567 aa8.57□□□□□ -1.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNX29Q8TEQ0 813 aa8.57□□□□□ -1.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa8.57□□□□□ -1.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EREGO14944 169 aa8.56□□□□□ -1.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRNPP04156 253 aa8.56□□□□□ -1.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PMEPA1Q969W9 287 aa8.56□□□□□ -1.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC39Q9UFE4 941 aa8.56□□□□□ -1.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PHACTR2O75167 634 aa8.55□□□□□ -1.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FOSL1P15407 271 aa8.55□□□□□ -1.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 JAG1P78504 1218 aa8.55□□□□□ -1.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FDX2Q6P4F2 183 aa8.55□□□□□ -1.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.55□□□□□ -1.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.55□□□□□ -1.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.55□□□□□ -1.04
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