RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	SNAP23	O00161	211 aa		21.62	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		21.62	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	21.62	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	RGMB	Q6NW40	437 aa		21.62	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	DLK2	Q6UY11	383 aa		21.62	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		21.62	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	21.62	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXW7	Q969H0	707 aa		21.62	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	21.62	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	21.62	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB22	O15209	634 aa		21.61	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	21.61	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		21.61	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	21.6	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	PLIN1	O60240	522 aa		21.6	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	DLGAP5	Q15398	846 aa		21.6	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		21.6	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		21.6	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	MXD3	Q9BW11	206 aa		21.6	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		21.6	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	21.59	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL24	Q5JXM2	366 aa		21.59	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	CERS5	Q8N5B7	392 aa		21.59	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	21.59	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	MRI	Q9BWK5	157 aa		21.59	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	21.58	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	21.58	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	UNCX	A6NJT0	531 aa		21.58	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	EYA2	O00167	538 aa		21.58	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	CIAO1	O76071	339 aa		21.58	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	GNAI3	P08754	354 aa		21.58	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	NF2	P35240	595 aa		21.58	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	LBX1	P52954	281 aa		21.58	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	21.58	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		21.58	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		21.58	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	21.57	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	MYO1B	O43795	1136 aa		21.57	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	AOC2	O75106	756 aa		21.57	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	21.57	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	FGFR2	P21802	821 aa		21.57	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	21.57	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	21.57	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC24	Q50LG9	513 aa		21.57	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		21.57	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	21.56	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	VPS37D	Q86XT2	251 aa		21.56	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1B0GUL6	1792 aa		21.56	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		21.55	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC10A3	P09131	477 aa		21.55	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SPDYE6	P0CI01	402 aa		21.55	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	GYG1	P46976	350 aa		21.55	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	21.55	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	LPIN2	Q92539	896 aa		21.55	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		21.55	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	MTX1	Q13505	466 aa		21.54	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		21.54	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		21.54	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	COPRS	Q9NQ92	184 aa		21.54	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CFAP100	Q494V2	611 aa		21.53	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		21.53	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		21.52	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		21.52	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	21.52	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFAIP1	Q13829	316 aa		21.52	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		21.52	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		21.52	■■□□□ 1.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC5A1	P13866	664 aa		21.51	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP3K11	Q16584	847 aa		21.51	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		21.51	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		21.51	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	21.51	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM27	P14373	513 aa		21.5	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		21.5	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		21.5	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	21.5	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	21.5	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	21.5	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	21.49	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	21.49	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		21.49	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	MEIS3	Q99687	375 aa		21.49	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TSKS	Q9UJT2	592 aa		21.49	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	MAST3	O60307	1309 aa		21.49	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SEMA3E	O15041	775 aa		21.48	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	21.48	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	BCAR3	O75815	825 aa		21.48	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		21.48	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	21.48	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		21.48	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424		F8W031	263 aa	Predicted RBP	21.47	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	BCAM	P50895	628 aa		21.47	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		21.47	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		21.47	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		21.47	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	21.47	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	CSRNP1	Q96S65	589 aa		21.47	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ZIC5	Q96T25	663 aa		21.47	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	21.47	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	21.46	■■□□□ 1.03

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