RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 PLIN1O60240 522 aa21.43■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 ALDH1L1O75891 902 aa21.43■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 PRKG1Q13976 671 aa21.43■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.43■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.43■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.43■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 F8W031 263 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 DLGAP5Q15398 846 aa21.42■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 KAZALD1Q96I82 304 aa21.42■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 SUCLG2Q96I99 432 aa21.42■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 FZD1Q9UP38 647 aa21.41■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 AOX1Q06278 1338 aa21.4■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 RGS19P49795 217 aa21.4■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.4■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.4■■□□□ 1.02
SKIV2L-211ENST00000485349 LAMB1P07942 1786 aa21.39■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 CFAP100Q494V2 611 aa21.39■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.39■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 CLRN2A0PK11 232 aa21.38■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.38■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 SPDYE6P0CI01 402 aa21.38■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 UTYO14607 1347 aa21.37■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 TBC1D8O95759 1140 aa21.37■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 GYG1P46976 350 aa21.37■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 OTOFQ9HC10 1997 aa21.37■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.36■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 TM4SF4P48230 202 aa21.36■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.36■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 UBE4AQ14139 1066 aa21.35■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 VEZTQ9HBM0 779 aa21.35■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.35■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 MYO1BO43795 1136 aa21.34■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 SREBF2Q12772 1141 aa21.34■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.34■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.34■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.34■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 HTTP42858 3142 aa21.34■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1.019e-7■■■■■ 29.5
SKIV2L-211ENST00000485349 SPRYD7Q5W111 196 aa21.33■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.33■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SKIV2L-211ENST00000485349 PTPRCP08575 1304 aa21.32■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.32■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 E9PSI1 815 aa21.32■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 MAP3K11Q16584 847 aa21.32■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 LRRC24Q50LG9 513 aa21.32■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.32■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 SOX10P56693 466 aa21.31■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 CENPFP49454 3210 aa21.3■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.3■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 GPR25O00155 361 aa21.3■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 RASA3Q14644 834 aa21.3■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 METTL24Q5JXM2 366 aa21.3■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.3■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.3■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.29■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.29■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.29■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.29■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 WNK4Q96J92 1243 aa21.29■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.29■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 SLFN5Q08AF3 891 aa21.28■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 GRIK5Q16478 980 aa21.28■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 CFHR5Q9BXR6 569 aa21.28■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 USP44Q9H0E7 712 aa21.28■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.28■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa21.28■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 CRKP46108 304 aa21.27■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.27■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 VPS37DQ86XT2 251 aa21.27■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.27■■□□□ 1
SKIV2L-211ENST00000485349 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
SKIV2L-211ENST00000485349 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.5 ms