RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431558.1

PRRT3-AS1-201, PRRT3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRT3-AS1, Length 614 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.46■□□□□ 0.87
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 F8W031 263 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 BCAR3O75815 825 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MAP2K2P36507 400 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MMP14P50281 582 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PDE8BO95263 885 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TNNQ9UQP3 1299 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LBX1P52954 281 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RGMBQ6NW40 437 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MEIS3Q99687 375 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 EYA2O00167 538 aa20.42■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MOB2Q70IA6 237 aa20.42■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TNS4Q8IZW8 715 aa20.42■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.42■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KIF16BQ96L93 1317 aa20.42■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FGFR2P21802 821 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DLGAP5Q15398 846 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 AOX1Q06278 1338 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TRIM27P14373 513 aa20.4■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 BCAMP50895 628 aa20.4■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CFAP100Q494V2 611 aa20.4■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.4■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NOGQ13253 232 aa20.39■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GRIK5Q16478 980 aa20.39■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TSKSQ9UJT2 592 aa20.39■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.38■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 VPS37DQ86XT2 251 aa20.38■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CCDC102AQ96A19 550 aa20.38■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 BEGAINQ9BUH8 593 aa20.38■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SIL1Q9H173 461 aa20.38■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SPDYE6P0CI01 402 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FKBP1BP68106 108 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CLRN2A0PK11 232 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SLC10A3P09131 477 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CIAO1O76071 339 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LPIN2Q92539 896 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FBXO3Q9UK99 471 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GNAI3P08754 354 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PRKG1Q13976 671 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 COPRSQ9NQ92 184 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FZD1Q9UP38 647 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SLC5A1P13866 664 aa20.33■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 VEZTQ9HBM0 779 aa20.33■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.33■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.33■□□□□ 0.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MYO1BO43795 1136 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NF2P35240 595 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CSRNP1Q96S65 589 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SRGAP3O43295 1099 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CAPN15O75808 1086 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CRKP46108 304 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MTX1Q13505 466 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ATP2B3Q16720 1220 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms