RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427786.1

PPP1CB-206, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PPP1CB, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-206ENST00000427786 BCAR3O75815 825 aa24.54■■□□□ 1.52
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PPP1CB-206ENST00000427786 FGFR2P21802 821 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP1CB-206ENST00000427786 IFFO2Q5TF58 517 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP1CB-206ENST00000427786 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
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PPP1CB-206ENST00000427786 C2orf69Q8N8R5 385 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP1CB-206ENST00000427786 FBXO3Q9UK99 471 aa24.5■■□□□ 1.51
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PPP1CB-206ENST00000427786 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.47■■□□□ 1.51
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PPP1CB-206ENST00000427786 ZIC5Q96T25 663 aa24.46■■□□□ 1.51
PPP1CB-206ENST00000427786 COPRSQ9NQ92 184 aa24.46■■□□□ 1.51
PPP1CB-206ENST00000427786 PRDM10Q9NQV6 1147 aa24.46■■□□□ 1.51
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PPP1CB-206ENST00000427786 SIL1Q9H173 461 aa24.44■■□□□ 1.5
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PPP1CB-206ENST00000427786 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
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PPP1CB-206ENST00000427786 MOB2Q70IA6 237 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP1CB-206ENST00000427786 VPS37DQ86XT2 251 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP1CB-206ENST00000427786 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PPP1CB-206ENST00000427786 SLC5A1P13866 664 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP1CB-206ENST00000427786 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
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PPP1CB-206ENST00000427786 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP1CB-206ENST00000427786 CCDC102AQ96A19 550 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP1CB-206ENST00000427786 LAMB1P07942 1786 aa24.4■■□□□ 1.5
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PPP1CB-206ENST00000427786 DEFB129Q9H1M3 183 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP1CB-206ENST00000427786 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
PPP1CB-206ENST00000427786 ATP2B3Q16720 1220 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP1CB-206ENST00000427786 TNS4Q8IZW8 715 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP1CB-206ENST00000427786 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP1CB-206ENST00000427786 CLRN2A0PK11 232 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-206ENST00000427786 ZBTB22O15209 634 aa24.38■■□□□ 1.49
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PPP1CB-206ENST00000427786 MYO1BO43795 1136 aa24.37■■□□□ 1.49
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PPP1CB-206ENST00000427786 CRKP46108 304 aa24.37■■□□□ 1.49
PPP1CB-206ENST00000427786 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PPP1CB-206ENST00000427786 OTOFQ9HC10 1997 aa24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-206ENST00000427786 UBE2Q2LH0YL09 131 aa24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-206ENST00000427786 CA12O43570 354 aa24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-206ENST00000427786 RLBP1P12271 317 aa24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-206ENST00000427786 NF2P35240 595 aa24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-206ENST00000427786 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
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