RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410856.1

RNU2-38P-201, Transcript of RNA, U2 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU2-38P, Length 79 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU2-38P-201ENST00000410856 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU2-38P-201ENST00000410856 ABTB2Q8N961 1025 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU2-38P-201ENST00000410856 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU2-38P-201ENST00000410856 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 CYP27A1Q02318 531 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 GPR152Q8TDT2 470 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 USP26Q9BXU7 913 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 SAP130Q9H0E3 1048 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 KANSL3Q9P2N6 904 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 SOX13Q9UN79 622 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 TNFRSF10BO14763 440 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 COL19A1Q14993 1142 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 DUSP27Q5VZP5 1158 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF438Q7Z4V0 828 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 STK11IPQ8N1F8 1099 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 FBLIM1Q8WUP2 373 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 IKBKEQ14164 716 aa5□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 PLCL1Q15111 1095 aa5□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 CDPF1Q6NVV7 123 aa5□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRIMPOLQ96LW4 560 aa5□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 ELP3Q9H9T3 547 aa5□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 DZANK1Q9NVP4 752 aa5□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMEM63CQ9P1W3 806 aa5□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 SALL4Q9UJQ4 1053 aa5□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC5A6Q9Y289 635 aa5□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 NFKBIEO00221 500 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRMT3O60678 531 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 RFX1P22670 979 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 CES1P23141 567 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 ADMP35318 185 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 MAP7Q14244 749 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF124Q15973 351 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 TPRNQ4KMQ1 711 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM26DQ5JW98 314 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 BSNDQ8WZ55 320 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC38A3Q99624 504 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 STIM2Q9P246 746 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM170BA6NMN3 283 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 OCLNQ16625 522 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF792Q3KQV3 632 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 KSR1Q8IVT5 923 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 SHISA5Q8N114 240 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 PMEPA1Q969W9 287 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 MISP3Q96FF7 219 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 MKNK1Q9BUB5 465 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 DRD2P14416 443 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 ACPPP15309 386 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 GATA6Q92908 595 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 CLUAP1Q96AJ1 413 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU2-38P-201ENST00000410856 ADH5P11766 374 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 PCSK2P16519 638 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 HGSNATQ68CP4 663 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF765Q7L2R6 523 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 TTC16Q8NEE8 873 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM168AQ92567 244 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 CNTN3Q9P232 1028 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 RAB6AP20340 208 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 XKR5Q6UX68 686 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 VN1R5Q7Z5H4 357 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 C1orf127Q8N9H9 656 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMEM40Q8WWA1 233 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 HHIPQ96QV1 700 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 DLGAP3O95886 979 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 GSTM4Q03013 218 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 CFAP70Q5T0N1 1121 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 NXPE3Q969Y0 559 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 OSMRQ99650 979 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU2-38P-201ENST00000410856 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms