RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403904.5

CSNK1E-204, Transcript of casein kinase 1 epsilon, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1E-204	ENST00000403904	PI16	Q6UXB8	463 aa		40.65	■■■■■ 4.1
CSNK1E-204	ENST00000403904	JAG2	Q9Y219	1238 aa		40.65	■■■■■ 4.1
CSNK1E-204	ENST00000403904	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		40.65	■■■■■ 4.1
CSNK1E-204	ENST00000403904	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		40.65	■■■■■ 4.1
CSNK1E-204	ENST00000403904	SNRK	Q9NRH2	765 aa		40.65	■■■■■ 4.1
CSNK1E-204	ENST00000403904	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	40.64	■■■■■ 4.1
CSNK1E-204	ENST00000403904	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		40.64	■■■■■ 4.1
CSNK1E-204	ENST00000403904	SEMA3E	O15041	775 aa		40.63	■■■■■ 4.09
CSNK1E-204	ENST00000403904	RGS3	P49796	1198 aa		40.63	■■■■■ 4.09
CSNK1E-204	ENST00000403904	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	40.63	■■■■■ 4.09
CSNK1E-204	ENST00000403904	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		40.63	■■■■■ 4.09
CSNK1E-204	ENST00000403904	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		40.63	■■■■■ 4.09
CSNK1E-204	ENST00000403904	GTF2I	P78347	998 aa		40.62	■■■■■ 4.09
CSNK1E-204	ENST00000403904	SPATA5	Q8NB90	893 aa		40.62	■■■■■ 4.09
CSNK1E-204	ENST00000403904	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		40.62	■■■■■ 4.09
CSNK1E-204	ENST00000403904	ERC2	O15083	957 aa		40.61	■■■■■ 4.09
CSNK1E-204	ENST00000403904	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	40.61	■■■■■ 4.09
CSNK1E-204	ENST00000403904	FBXW7	Q969H0	707 aa		40.61	■■■■■ 4.09
CSNK1E-204	ENST00000403904	FZD9	O00144	591 aa		40.6	■■■■■ 4.09
CSNK1E-204	ENST00000403904	RAD17	O75943	681 aa		40.6	■■■■■ 4.09
CSNK1E-204	ENST00000403904	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	40.6	■■■■■ 4.09
CSNK1E-204	ENST00000403904	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		40.6	■■■■■ 4.09
CSNK1E-204	ENST00000403904	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		40.6	■■■■■ 4.09
CSNK1E-204	ENST00000403904	ZBTB22	O15209	634 aa		40.59	■■■■■ 4.09
CSNK1E-204	ENST00000403904	ZAP70	P43403	619 aa		40.58	■■■■■ 4.09
CSNK1E-204	ENST00000403904	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	40.58	■■■■■ 4.09
CSNK1E-204	ENST00000403904	AOX1	Q06278	1338 aa		40.58	■■■■■ 4.09
CSNK1E-204	ENST00000403904	CXCL9	Q07325	125 aa		40.57	■■■■■ 4.09
CSNK1E-204	ENST00000403904	PSME4	Q14997	1843 aa		40.57	■■■■■ 4.09
CSNK1E-204	ENST00000403904	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		40.57	■■■■■ 4.08
CSNK1E-204	ENST00000403904	USP17L3	A6NCW0	530 aa		40.57	■■■■■ 4.08
CSNK1E-204	ENST00000403904	USP17L4	A6NCW7	530 aa		40.57	■■■■■ 4.08
CSNK1E-204	ENST00000403904	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		40.57	■■■■■ 4.08
CSNK1E-204	ENST00000403904	HAUS7	Q99871	368 aa		40.57	■■■■■ 4.08
CSNK1E-204	ENST00000403904	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	40.55	■■■■■ 4.08
CSNK1E-204	ENST00000403904	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		40.55	■■■■■ 4.08
CSNK1E-204	ENST00000403904	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	40.55	■■■■■ 4.08
CSNK1E-204	ENST00000403904	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	40.54	■■■■■ 4.08
CSNK1E-204	ENST00000403904	PSMD14	O00487	310 aa		40.53	■■■■■ 4.08
CSNK1E-204	ENST00000403904	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	40.53	■■■■■ 4.08
CSNK1E-204	ENST00000403904	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	40.53	■■■■■ 4.08
CSNK1E-204	ENST00000403904	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	40.53	■■■■■ 4.08
CSNK1E-204	ENST00000403904	MXD3	Q9BW11	206 aa		40.53	■■■■■ 4.08
CSNK1E-204	ENST00000403904	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		40.53	■■■■■ 4.08
CSNK1E-204	ENST00000403904	DACT2	Q5SW24	774 aa		40.52	■■■■■ 4.08
CSNK1E-204	ENST00000403904	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		40.52	■■■■■ 4.08
CSNK1E-204	ENST00000403904	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		40.52	■■■■■ 4.08
CSNK1E-204	ENST00000403904	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		40.52	■■■■■ 4.08
CSNK1E-204	ENST00000403904	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		40.52	■■■■■ 4.08
CSNK1E-204	ENST00000403904	GOLIM4	O00461	696 aa		40.51	■■■■■ 4.08
CSNK1E-204	ENST00000403904	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		40.51	■■■■■ 4.08
CSNK1E-204	ENST00000403904	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		40.5	■■■■■ 4.07
CSNK1E-204	ENST00000403904	TTC22	Q5TAA0	569 aa		40.49	■■■■■ 4.07
CSNK1E-204	ENST00000403904	ABCF2	Q9UG63	623 aa		40.49	■■■■■ 4.07
CSNK1E-204	ENST00000403904	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	40.48	■■■■■ 4.07
CSNK1E-204	ENST00000403904	TNIP1	Q15025	636 aa		40.48	■■■■■ 4.07
CSNK1E-204	ENST00000403904	CERS5	Q8N5B7	392 aa		40.48	■■■■■ 4.07
CSNK1E-204	ENST00000403904	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		40.48	■■■■■ 4.07
CSNK1E-204	ENST00000403904	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	40.48	■■■■■ 4.07
CSNK1E-204	ENST00000403904	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		40.48	■■■■■ 4.07
CSNK1E-204	ENST00000403904	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	40.47	■■■■■ 4.07
CSNK1E-204	ENST00000403904	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		40.47	■■■■■ 4.07
CSNK1E-204	ENST00000403904	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	40.46	■■■■■ 4.07
CSNK1E-204	ENST00000403904	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	40.46	■■■■■ 4.07
CSNK1E-204	ENST00000403904	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	40.46	■■■■■ 4.07
CSNK1E-204	ENST00000403904	GRIK5	Q16478	980 aa		40.45	■■■■■ 4.07
CSNK1E-204	ENST00000403904	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	40.44	■■■■■ 4.06
CSNK1E-204	ENST00000403904	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		40.44	■■■■■ 4.06
CSNK1E-204	ENST00000403904	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	40.44	■■■■■ 4.06
CSNK1E-204	ENST00000403904	PRDX5	P30044	214 aa		40.43	■■■■■ 4.06
CSNK1E-204	ENST00000403904	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	40.43	■■■■■ 4.06
CSNK1E-204	ENST00000403904	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	40.43	■■■■■ 4.06
CSNK1E-204	ENST00000403904	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		40.42	■■■■■ 4.06
CSNK1E-204	ENST00000403904	GPC2	Q8N158	579 aa		40.41	■■■■■ 4.06
CSNK1E-204	ENST00000403904	RILPL2	Q969X0	211 aa		40.4	■■■■■ 4.06
CSNK1E-204	ENST00000403904	DOCK2	Q92608	1830 aa		40.4	■■■■■ 4.06
CSNK1E-204	ENST00000403904	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		40.4	■■■■■ 4.06
CSNK1E-204	ENST00000403904		F8W031	263 aa	Predicted RBP	40.4	■■■■■ 4.06
CSNK1E-204	ENST00000403904	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	40.4	■■■■■ 4.06
CSNK1E-204	ENST00000403904	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	40.4	■■■■■ 4.06
CSNK1E-204	ENST00000403904	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	40.4	■■■■■ 4.06
CSNK1E-204	ENST00000403904	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		40.4	■■■■■ 4.06
CSNK1E-204	ENST00000403904	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		40.4	■■■■■ 4.06
CSNK1E-204	ENST00000403904	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	40.39	■■■■■ 4.06
CSNK1E-204	ENST00000403904	EVI5L	Q96CN4	794 aa		40.39	■■■■■ 4.06
CSNK1E-204	ENST00000403904	GML	Q99445	158 aa		40.39	■■■■■ 4.06
CSNK1E-204	ENST00000403904	RAI14	Q9P0K7	980 aa		40.39	■■■■■ 4.06
CSNK1E-204	ENST00000403904	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		40.38	■■■■■ 4.05
CSNK1E-204	ENST00000403904	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		40.38	■■■■■ 4.05
CSNK1E-204	ENST00000403904	AK9	Q5TCS8	1911 aa		40.37	■■■■■ 4.05
CSNK1E-204	ENST00000403904	CNTROB	Q8N137	903 aa		40.37	■■■■■ 4.05
CSNK1E-204	ENST00000403904	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		40.37	■■■■■ 4.05
CSNK1E-204	ENST00000403904	SDS	P20132	328 aa		40.36	■■■■■ 4.05
CSNK1E-204	ENST00000403904	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	40.36	■■■■■ 4.05
CSNK1E-204	ENST00000403904	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		40.36	■■■■■ 4.05
CSNK1E-204	ENST00000403904	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	40.35	■■■■■ 4.05
CSNK1E-204	ENST00000403904	FSD1	Q9BTV5	496 aa		40.35	■■■■■ 4.05
CSNK1E-204	ENST00000403904	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	40.34	■■■■■ 4.05
CSNK1E-204	ENST00000403904	MAP3K12	Q12852	859 aa		40.34	■■■■■ 4.05
CSNK1E-204	ENST00000403904	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		40.34	■■■■■ 4.05

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