RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
AMIGO1-201ENST00000369862 CHST3Q7LGC8 479 aa28.04■■■□□ 2.08
AMIGO1-201ENST00000369862 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
AMIGO1-201ENST00000369862 ABCC12Q96J65 1359 aa28.04■■■□□ 2.08
AMIGO1-201ENST00000369862 MCAMP43121 646 aa28.04■■■□□ 2.08
AMIGO1-201ENST00000369862 RESTQ13127 1097 aa28.04■■■□□ 2.08
AMIGO1-201ENST00000369862 ANO6Q4KMQ2 910 aa28.04■■■□□ 2.08
AMIGO1-201ENST00000369862 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
AMIGO1-201ENST00000369862 CKAP2LQ8IYA6 745 aa28.04■■■□□ 2.08
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF710Q8N1W2 664 aa28.04■■■□□ 2.08
AMIGO1-201ENST00000369862 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
AMIGO1-201ENST00000369862 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
AMIGO1-201ENST00000369862 CBX8Q9HC52 389 aa28.04■■■□□ 2.08
AMIGO1-201ENST00000369862 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
AMIGO1-201ENST00000369862 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
AMIGO1-201ENST00000369862 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
AMIGO1-201ENST00000369862 SLIT2O94813 1529 aa28.03■■■□□ 2.08
AMIGO1-201ENST00000369862 ERVV-1B6SEH8 477 aa28.03■■■□□ 2.08
AMIGO1-201ENST00000369862 CNNM1Q9NRU3 951 aa28.03■■■□□ 2.08
AMIGO1-201ENST00000369862 APPBP2Q92624 585 aa28.02■■■□□ 2.08
AMIGO1-201ENST00000369862 PDE8AO60658 829 aa28.01■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 CCT2P78371 535 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF34Q8IZ26 560 aa28.01■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 PTGS1P23219 599 aa28■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 FGAP02671 866 aa28■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 HAND2P61296 217 aa28■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 TSC1Q92574 1164 aa28■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 PGBD1Q96JS3 809 aa28■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 PTPDC1A2A3K4 754 aa27.99■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 H3BQV1 296 aa27.99■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 IFFO2Q5TF58 517 aa27.99■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 BICD2Q8TD16 824 aa27.99■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 NR1I2O75469 434 aa27.99■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 PLA2G4DQ86XP0 818 aa27.99■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 CTNNA3Q9UI47 895 aa27.99■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 PDE8BO95263 885 aa27.98■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 CAVIN2O95810 425 aa27.98■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 SALL1Q9NSC2 1324 aa27.98■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 GPAA1O43292 621 aa27.97■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF75DP51815 510 aa27.97■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 FBXL16Q8N461 479 aa27.97■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 CFAP45Q9UL16 551 aa27.97■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 LRP5O75197 1615 aa27.96■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 EIF5P55010 431 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC186Q7Z3E2 898 aa27.96■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 ARID3AQ99856 593 aa27.96■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.96■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 PPFIA3O75145 1194 aa27.95■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF165P49910 485 aa27.95■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 FOSBP53539 338 aa27.95■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIM5Q9C035 493 aa27.95■■■□□ 2.07
AMIGO1-201ENST00000369862 MYH15Q9Y2K3 1946 aa27.95■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa27.95■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 ADD2P35612 726 aa27.94■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 PHKA1P46020 1223 aa27.94■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 EVCP57679 992 aa27.94■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 ADAMTS2O95450 1211 aa27.94■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC102BQ68D86 513 aa27.94■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 DRC7Q8IY82 874 aa27.94■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP27.94■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 ADD1P35611 737 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 SUSD4Q5VX71 490 aa27.93■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 ACSBG1Q96GR2 724 aa27.93■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 NRAPQ86VF7 1730 aa27.93■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 DDB1Q16531 1140 aa27.92■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa27.92■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 DNAJC25Q9H1X3 360 aa27.92■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 A0A0G2JS52 829 aa27.92■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC87Q9NVE4 849 aa27.92■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 CTIFO43310 598 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 CRKLP46109 303 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 ANTXR2P58335 489 aa27.91■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 ATRNO75882 1429 aa27.91■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 FGFR2P21802 821 aa27.91■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 CDC25BP30305 580 aa27.91■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa27.91■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 PRC1O43663 620 aa27.9■■■□□ 2.06
AMIGO1-201ENST00000369862 FDPSP14324 419 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms