RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 GP2P55259 537 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 DTX1Q86Y01 620 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 OSMRQ99650 979 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 PAX4O43316 350 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 EDN3P14138 238 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 EHHADHQ08426 723 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 SNX29Q8TEQ0 813 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 POLIQ9UNA4 740 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 EREGO14944 169 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 PHACTR2O75167 634 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 TNFRSF21O75509 655 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 HGSNATQ68CP4 663 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 SUGCTQ9HAC7 445 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 USP5P45974 858 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 IKBKEQ14164 716 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 FMNL2Q96PY5 1086 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 ADAMTS4O75173 837 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 FAM13AO94988 1023 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 TIAF1O95411 115 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 MTMR3Q13615 1198 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 NUTM2GQ5VZR2 741 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 CYP4F12Q9HCS2 524 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 ARID3CA6NKF2 412 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 FZD6O60353 706 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 WNT11O96014 354 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 MTMR7Q9Y216 660 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 WDR64B1ANS9 1081 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 TXKP42681 527 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 SGO2Q562F6 1265 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 GJD3Q8N144 294 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 USP26Q9BXU7 913 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 PIM2Q9P1W9 311 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 AAMPQ13685 434 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 MFSD14AQ96MC6 490 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 DLGAP3O95886 979 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 NRSN2Q9GZP1 204 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 F13BP05160 661 aa8.29□□□□□ -1.08
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PTPRK-202ENST00000368205 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 ATG3Q9NT62 314 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 MSMPQ1L6U9 139 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-202ENST00000368205 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 BTBD11A6QL63 1104 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 FOSL1P15407 271 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 GSTM4Q03013 218 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 PAOXQ6QHF9 649 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 CCNJLQ8IV13 435 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 ADGRE2Q9UHX3 823 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 A0A096LPE4 126 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 A0A1W2PPZ6 126 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 METTL12A8MUP2 240 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 PRNPP04156 253 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 DRD2P14416 443 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 USP11P51784 963 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 NFKBIBQ15653 356 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 FBXL6Q8N531 539 aa8.25□□□□□ -1.09
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