RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362830.1

RNU6-223P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 223, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-223P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-223P-201ENST00000362830 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 ALX3O95076 343 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 CCNJLQ8IV13 435 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZNF428Q96B54 188 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 GPR182O15218 404 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 ADAM11O75078 769 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 WISP1O95388 367 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 ORC1Q13415 861 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 IKBKEQ14164 716 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLC51AQ86UW1 340 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 TMC1Q8TDI8 760 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 TCF12Q99081 682 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 CEP41Q9BYV8 373 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 A0A096LPE4 126 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 A0A1W2PPZ6 126 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 ACAD11Q709F0 780 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 CSRNP1Q96S65 589 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 MEGF11A6BM72 1044 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 GLB1P16278 677 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 UVSSAQ2YD98 709 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.03□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-223P-201ENST00000362830 GRIA4P48058 902 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 HGSNATQ68CP4 663 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 TMC7Q7Z402 723 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 RNF208Q9H0X6 261 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 NPHS2Q9NP85 383 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 METTL12A8MUP2 240 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 ITPKAP23677 461 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 NLRP12P59046 1061 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 DSC3Q14574 896 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 EHD4Q9H223 541 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 TREHO43280 583 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 MAPK1P28482 360 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 PLCB3Q01970 1234 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 PCDH1Q08174 1060 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 TRAK1Q9UPV9 953 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 RAXQ9Y2V3 346 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 DHX15O43143 795 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 ARMC10Q8N2F6 343 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 MYRFLQ96LU7 910 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 NRSN2Q9GZP1 204 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 SUGCTQ9HAC7 445 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 GSC2O15499 205 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 B3GALT4O96024 378 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 CYP11A1P05108 521 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 GSTM4Q03013 218 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 GLIS3Q8NEA6 775 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 ASB16Q96NS5 453 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZNF576Q9H609 170 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 ABCB6Q9NP58 842 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-223P-201ENST00000362830 NLRP2Q9NX02 1062 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms