RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 ADRA2BP18089 450 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 UBE3CQ15386 1083 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 NPHP1O15259 732 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 TM4SF1P30408 202 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 MCTP1Q6DN14 999 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.28■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 E7EWF7 191 aa21.28■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 GYG1P46976 350 aa21.28■■□□□ 1
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ACTB-201ENST00000331789 Q6ZUG5 572 aa21.28■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.28■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
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ACTB-201ENST00000331789 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.27■■□□□ 1
ACTB-201ENST00000331789 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.27■■□□□ 1
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ACTB-201ENST00000331789 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF827Q17R98 1081 aa21.17■□□□□ 0.98
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ACTB-201ENST00000331789 ALX1Q15699 326 aa21.16■□□□□ 0.98
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ACTB-201ENST00000331789 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.16■□□□□ 0.98
ACTB-201ENST00000331789 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.16■□□□□ 0.98
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