RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322054.9

EHD3-201, Transcript of EH domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EHD3, Length 4,636 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3-201ENST00000322054 CCDC87Q9NVE4 849 aa18.53■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 ZAP70P43403 619 aa18.53■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 ARMT1Q9H993 441 aa18.53■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 SETQ01105 290 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 TAF4BQ92750 862 aa18.53■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 CALM1P0DP23 149 aa18.52■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 CALM2P0DP24 149 aa18.52■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 CALM3P0DP25 149 aa18.52■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 TMX1Q9H3N1 280 aa18.52■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa18.52■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 DHX58Q96C10 678 aa18.52■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 PALD1Q9ULE6 856 aa18.52■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 NAPAP54920 295 aa18.52■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 WWC2Q6AWC2 1192 aa18.52■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 TRIM47Q96LD4 638 aa18.52■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 RDXP35241 583 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 RRAGBQ5VZM2 374 aa18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 LPIN2Q92539 896 aa18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 DENND2AQ9ULE3 1009 aa18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 CLCN1P35523 988 aa18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 STAT6P42226 847 aa18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 CCDC40Q4G0X9 1142 aa18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 TRAPPC3LQ5T215 181 aa18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 IQCEQ6IPM2 695 aa18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 TMCO3Q6UWJ1 677 aa18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 CCDC24Q8N4L8 307 aa18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 KDRP35968 1356 aa18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 RTL9Q8NET4 1388 aa18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 A0A1B0GVL5 298 aa18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 SKILP12757 684 aa18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 CALML3P27482 149 aa18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 TCERG1LQ5VWI1 586 aa18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 TET3O43151 1660 aa18.51■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.5■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 ERLIN2O94905 339 aa18.5■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa18.5■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 RIMBP2O15034 1052 aa18.5■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 RRP9O43818 475 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 PRDM1O75626 825 aa18.5■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 CASQ1P31415 396 aa18.5■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 CCDC150Q8NCX0 1101 aa18.5■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 TM6SF1Q9BZW5 370 aa18.5■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 A0A0D9SFI3 127 aa18.49■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 PLCG2P16885 1265 aa18.49■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 CNBD1Q8NA66 436 aa18.49■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 TMEM87BQ96K49 555 aa18.49■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 TSPOAP1O95153 1857 aa18.49■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 PTH1RQ03431 593 aa18.49■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 IQGAP3Q86VI3 1631 aa18.49■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 DNA2P51530 1060 aa18.49■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 FAM193AP78312 1265 aa18.49■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 WDR78Q5VTH9 848 aa18.48■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 LUZP1Q86V48 1076 aa18.48■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 RBSNQ9H1K0 784 aa18.48■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 CENPHQ9H3R5 247 aa18.48■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 JAK2O60674 1132 aa18.48■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 RMND1Q9NWS8 449 aa18.48■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 CCDC102AQ96A19 550 aa18.48■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 EXOC1Q9NV70 894 aa18.48■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa18.47■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa18.47■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 GNG11P61952 73 aa18.47■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 VPS36Q86VN1 386 aa18.47■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 GOLGA6L10A6NI86 522 aa18.47■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 USO1O60763 962 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 SIRT2Q8IXJ6 389 aa18.47■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 OGFOD1Q8N543 542 aa18.47■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 SHROOM2Q13796 1616 aa18.47■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 ADCY10Q96PN6 1610 aa18.47■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 ATL3Q6DD88 541 aa18.47■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 LEKR1Q6ZMV7 388 aa18.47■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 KRT2P35908 639 aa18.46■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 UNC5CLQ8IV45 518 aa18.46■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa18.46■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 EHMT1Q9H9B1 1298 aa18.46■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 ZNF532Q9HCE3 1301 aa18.46■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 C6orf50Q9HD87 102 aa18.46■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 ERBB4Q15303 1308 aa18.46■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 WWC3Q9ULE0 1092 aa18.46■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 BCORL1Q5H9F3 1711 aa18.46■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 BRD1O95696 1058 aa18.46■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
EHD3-201ENST00000322054 FAM160A1Q05DH4 1040 aa18.45■□□□□ 0.54
EHD3-201ENST00000322054 SPAG1Q07617 926 aa18.45■□□□□ 0.54
EHD3-201ENST00000322054 MYL10Q9BUA6 226 aa18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms