RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301323.7

RECQL4-201, Transcript of RecQ like helicase 4, humanhuman

TSL 3

Gene RECQL4, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4-201ENST00000301323 PDE8BO95263 885 aa20.57■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 ECE1P42892 770 aa20.57■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.56■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 AIDAQ96BJ3 306 aa20.56■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 WBP1LQ9NX94 342 aa20.56■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 JAG2Q9Y219 1238 aa20.56■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 EYA2O00167 538 aa20.55■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.55■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 FGFR2P21802 821 aa20.54■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 HUNKP57058 714 aa20.54■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.54■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.54■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 GRM1Q13255 1194 aa20.53■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.53■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 AOC2O75106 756 aa20.52■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 CIAO1O76071 339 aa20.52■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 FBXO3Q9UK99 471 aa20.52■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.52■□□□□ 0.88
RECQL4-201ENST00000301323 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.51■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 F8W031 263 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 GNAI3P08754 354 aa20.51■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 MTX1Q13505 466 aa20.51■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.51■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 C2orf69Q8N8R5 385 aa20.51■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.51■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 MAP2K2P36507 400 aa20.5■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.5■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.5■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 SIL1Q9H173 461 aa20.5■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 AOX1Q06278 1338 aa20.5■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.49■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 SPDYE6P0CI01 402 aa20.49■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 DLGAP5Q15398 846 aa20.49■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 CFAP100Q494V2 611 aa20.49■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.49■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 RGMBQ6NW40 437 aa20.49■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 COPRSQ9NQ92 184 aa20.49■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.48■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 BCAMP50895 628 aa20.48■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 FKBP1BP68106 108 aa20.48■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.48■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 VPS37DQ86XT2 251 aa20.48■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.48■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 SLC5A1P13866 664 aa20.47■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 LBX1P52954 281 aa20.47■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 NOGQ13253 232 aa20.47■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 GRIK5Q16478 980 aa20.47■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 LPIN2Q92539 896 aa20.47■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.47■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 ATP2B3Q16720 1220 aa20.46■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 ZIC5Q96T25 663 aa20.46■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.46■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RECQL4-201ENST00000301323 SRGAP3O43295 1099 aa20.45■□□□□ 0.86
RECQL4-201ENST00000301323 SLC10A3P09131 477 aa20.45■□□□□ 0.86
RECQL4-201ENST00000301323 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
RECQL4-201ENST00000301323 MOB2Q70IA6 237 aa20.45■□□□□ 0.86
RECQL4-201ENST00000301323 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.45■□□□□ 0.86
RECQL4-201ENST00000301323 CLRN2A0PK11 232 aa20.44■□□□□ 0.86
RECQL4-201ENST00000301323 GNAI2P04899 355 aa20.44■□□□□ 0.86
RECQL4-201ENST00000301323 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.44■□□□□ 0.86
RECQL4-201ENST00000301323 MYO1BO43795 1136 aa20.43■□□□□ 0.86
RECQL4-201ENST00000301323 RLBP1P12271 317 aa20.43■□□□□ 0.86
RECQL4-201ENST00000301323 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
RECQL4-201ENST00000301323 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.43■□□□□ 0.86
RECQL4-201ENST00000301323 CCDC102AQ96A19 550 aa20.43■□□□□ 0.86
RECQL4-201ENST00000301323 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.43■□□□□ 0.86
RECQL4-201ENST00000301323 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.43■□□□□ 0.86
RECQL4-201ENST00000301323 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
RECQL4-201ENST00000301323 NF2P35240 595 aa20.42■□□□□ 0.86
RECQL4-201ENST00000301323 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.42■□□□□ 0.86
RECQL4-201ENST00000301323 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.41■□□□□ 0.86
RECQL4-201ENST00000301323 CRKP46108 304 aa20.41■□□□□ 0.86
RECQL4-201ENST00000301323 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
RECQL4-201ENST00000301323 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
RECQL4-201ENST00000301323 BEGAINQ9BUH8 593 aa20.41■□□□□ 0.86
RECQL4-201ENST00000301323 ZBTB22O15209 634 aa20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms