RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 TRIM75PA6NK02 468 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 ERLIN1O75477 346 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 PAF1Q8N7H5 531 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 RAD50Q92878 1312 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 PRR36Q9H6K5 1346 aa6.32□□□□□ -1.4
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LMO3-201ENST00000261169 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 VWA3AA6NCI4 1184 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 TMCO5BA8MYB1 307 aa6.32□□□□□ -1.4
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LMO3-201ENST00000261169 TNNI2P48788 182 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 NAPAP54920 295 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 PPARDQ03181 441 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 TMEM266Q2M3C6 531 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 KBTBD3Q8NAB2 608 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.32□□□□□ -1.4
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LMO3-201ENST00000261169 KRT23Q9C075 422 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 KCNJ14Q9UNX9 436 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 SHANK2Q9UPX8 1470 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 SH3TC1Q8TE82 1336 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 ZNF521Q96K83 1311 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 ZFYVE9O95405 1425 aa6.31□□□□□ -1.4
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LMO3-201ENST00000261169 CRACR2AQ9BSW2 395 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 JADE2Q9NQC1 790 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 ADGRL2O95490 1459 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 ABCC4O15439 1325 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 STAT6P42226 847 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 ASIC1P78348 528 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 MCM6Q14566 821 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 SSH3Q8TE77 659 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 CALML4Q96GE6 196 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 RAB34Q9BZG1 259 aa6.31□□□□□ -1.4
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LMO3-201ENST00000261169 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
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LMO3-201ENST00000261169 ANKRD62A6NC57 917 aa6.31□□□□□ -1.4
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LMO3-201ENST00000261169 YEATS4O95619 227 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 HSPA4P34932 840 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 UVSSAQ2YD98 709 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 PI16Q6UXB8 463 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 ATP7AQ04656 1500 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 ARAP3Q8WWN8 1544 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 GSDMDP57764 484 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 BEND3Q5T5X7 828 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 CFAP74Q9C0B2 1584 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 GOLGA6L10A6NI86 522 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 PHACTR2O75167 634 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 SP4Q02446 784 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 LETM2Q2VYF4 491 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 SYT10Q6XYQ8 523 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
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LMO3-201ENST00000261169 CCDC148Q8NFR7 591 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 APPBP2Q92624 585 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 VEZTQ9HBM0 779 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 SLAIN2Q9P270 581 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 TPCN1Q9ULQ1 816 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 ADCY10Q96PN6 1610 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 CCDC66A2RUB6 948 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 TMTC2Q8N394 836 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 FAM107BQ9H098 131 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 CNNM2Q9H8M5 875 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 PKD2L1Q9P0L9 805 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 ZNF532Q9HCE3 1301 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 TMEM2Q9UHN6 1383 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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