RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259216.4

CFC1-201, Transcript of cripto, FRL-1, cryptic family 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CFC1, Length 1,046 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1-201ENST00000259216 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CFC1-201ENST00000259216 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
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CFC1-201ENST00000259216 METTL24Q5JXM2 366 aa25.38■■□□□ 1.65
CFC1-201ENST00000259216 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.38■■□□□ 1.65
CFC1-201ENST00000259216 JAG2Q9Y219 1238 aa25.38■■□□□ 1.65
CFC1-201ENST00000259216 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CFC1-201ENST00000259216 EYA2O00167 538 aa25.37■■□□□ 1.65
CFC1-201ENST00000259216 AOC2O75106 756 aa25.37■■□□□ 1.65
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CFC1-201ENST00000259216 MTMR14Q8NCE2 650 aa25.37■■□□□ 1.65
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CFC1-201ENST00000259216 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.36■■□□□ 1.65
CFC1-201ENST00000259216 AOX1Q06278 1338 aa25.36■■□□□ 1.65
CFC1-201ENST00000259216 MAP2K2P36507 400 aa25.35■■□□□ 1.65
CFC1-201ENST00000259216 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.35■■□□□ 1.65
CFC1-201ENST00000259216 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
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CFC1-201ENST00000259216 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.35■■□□□ 1.65
CFC1-201ENST00000259216 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.34■■□□□ 1.65
CFC1-201ENST00000259216 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CFC1-201ENST00000259216 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CFC1-201ENST00000259216 ZIC5Q96T25 663 aa25.34■■□□□ 1.65
CFC1-201ENST00000259216 GRM1Q13255 1194 aa25.33■■□□□ 1.65
CFC1-201ENST00000259216 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.33■■□□□ 1.65
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CFC1-201ENST00000259216 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.31■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 SPDYE6P0CI01 402 aa25.31■■□□□ 1.64
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CFC1-201ENST00000259216 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 MTX1Q13505 466 aa25.31■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 GRIK5Q16478 980 aa25.31■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.31■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 RGMBQ6NW40 437 aa25.31■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 F8W031 263 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 BCAMP50895 628 aa25.3■■□□□ 1.64
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CFC1-201ENST00000259216 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 COPRSQ9NQ92 184 aa25.3■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.3■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 FKBP1BP68106 108 aa25.29■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 CFAP100Q494V2 611 aa25.29■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 AIDAQ96BJ3 306 aa25.29■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.29■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 GNAI3P08754 354 aa25.28■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 NOGQ13253 232 aa25.28■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 MOB2Q70IA6 237 aa25.28■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.28■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 SIL1Q9H173 461 aa25.28■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.27■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 LBX1P52954 281 aa25.27■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 LPIN2Q92539 896 aa25.27■■□□□ 1.64
CFC1-201ENST00000259216 SLC10A3P09131 477 aa25.26■■□□□ 1.63
CFC1-201ENST00000259216 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
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CFC1-201ENST00000259216 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.26■■□□□ 1.63
CFC1-201ENST00000259216 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.26■■□□□ 1.63
CFC1-201ENST00000259216 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.26■■□□□ 1.63
CFC1-201ENST00000259216 CCDC102AQ96A19 550 aa25.25■■□□□ 1.63
CFC1-201ENST00000259216 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
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CFC1-201ENST00000259216 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.24■■□□□ 1.63
CFC1-201ENST00000259216 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.24■■□□□ 1.63
CFC1-201ENST00000259216 CLRN2A0PK11 232 aa25.23■■□□□ 1.63
CFC1-201ENST00000259216 RLBP1P12271 317 aa25.23■■□□□ 1.63
CFC1-201ENST00000259216 SLC5A1P13866 664 aa25.23■■□□□ 1.63
CFC1-201ENST00000259216 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CFC1-201ENST00000259216 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CFC1-201ENST00000259216 ATP2B3Q16720 1220 aa25.23■■□□□ 1.63
CFC1-201ENST00000259216 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.23■■□□□ 1.63
CFC1-201ENST00000259216 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.22■■□□□ 1.63
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CFC1-201ENST00000259216 TNS4Q8IZW8 715 aa25.22■■□□□ 1.63
CFC1-201ENST00000259216 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa25.22■■□□□ 1.63
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CFC1-201ENST00000259216 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CFC1-201ENST00000259216 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.2■■□□□ 1.62
CFC1-201ENST00000259216 GNAI2P04899 355 aa25.2■■□□□ 1.62
CFC1-201ENST00000259216 CRKP46108 304 aa25.2■■□□□ 1.62
CFC1-201ENST00000259216 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CFC1-201ENST00000259216 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.2■■□□□ 1.62
CFC1-201ENST00000259216 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.2■■□□□ 1.62
CFC1-201ENST00000259216 ADORA1P30542 326 aa25.19■■□□□ 1.62
CFC1-201ENST00000259216 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
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