RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sulf1Q8K007 870 aa27■■□□□ 1.91
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam83aQ8K2P2 436 aa26.99■■□□□ 1.91
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sh3bp5Q9Z131 463 aa26.99■■□□□ 1.91
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Btbd19S4R1I0 287 aa26.99■■□□□ 1.91
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nup98Q6PFD9 1816 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa26.97■■□□□ 1.91
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Spata18Q0P557 537 aa26.93■■□□□ 1.9
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zgrf1Q0VGT4 1863 aa26.91■■□□□ 1.9
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Irx3P81067 507 aa26.91■■□□□ 1.9
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ildr1Q8CBR1 537 aa26.9■■□□□ 1.9
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 NexnQ7TPW1 607 aa26.89■■□□□ 1.9
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Grm8P47743 908 aa26.88■■□□□ 1.89
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Npr3P70180 536 aa26.88■■□□□ 1.89
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cnksr2Q80YA9 1032 aa26.88■■□□□ 1.89
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc148Q6P5U8 527 aa26.87■■□□□ 1.89
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pank1Q8K4K6 548 aa26.87■■□□□ 1.89
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cfap44E9Q5M6 1843 aa26.87■■□□□ 1.89
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 L1camP11627 1260 aa26.86■■□□□ 1.89
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gpr182P43142 395 aa26.86■■□□□ 1.89
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mapk4Q6P5G0 583 aa26.86■■□□□ 1.89
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sgpl1Q8R0X7 568 aa26.85■■□□□ 1.89
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gnat3Q3V3I2 354 aa26.84■■□□□ 1.89
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zbtb9Q8CDC7 459 aa26.84■■□□□ 1.89
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Smc4Q8CG47 1286 aa26.84■■□□□ 1.89
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Aldh1l2Q8K009 923 aa26.84■■□□□ 1.89
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ripk4Q9ERK0 786 aa26.84■■□□□ 1.89
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Myh15E9Q264 1925 aa26.84■■□□□ 1.89
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm15262A0A140LIQ5 728 aa26.83■■□□□ 1.89
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rhbdl3P58873 404 aa26.83■■□□□ 1.89
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 VgfQ0VGU4 617 aa26.83■■□□□ 1.89
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmem39bQ810L4 492 aa26.83■■□□□ 1.89
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ddx55Q6ZPL9 600 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 SpidrQ8BGX7 933 aa26.82■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trmt44Q9D2Q2 713 aa26.82■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pdzrn4E9PUZ9 1014 aa26.81■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 March10E9PX79 788 aa26.81■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mbtps2Q8CHX6 515 aa26.81■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kiaa0100Q5SYL3 2234 aa26.8■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Otud5Q3U2S4 566 aa26.8■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CrkQ64010 304 aa26.8■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ces5aQ6AW46 575 aa26.8■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Znf784Q8BI69 297 aa26.8■■□□□ 1.88
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zc3h4Q6ZPZ3 1304 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Myh4Q5SX39 1939 aa26.79■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fzd1O70421 642 aa26.79■■□□□ 1.88
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gjc2Q8BQU6 440 aa26.79■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmc2Q8R4P4 888 aa26.79■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cry2Q9R194 592 aa26.79■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Stk36Q69ZM6 1316 aa26.79■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tbc1d8bA3KGB4 1114 aa26.78■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam83bQ0VBM2 1012 aa26.78■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lgr6Q3UVD5 967 aa26.78■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm11437Q5QR91 290 aa26.78■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rnf208Q8K0W3 265 aa26.78■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ncoa5Q91W39 579 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Il21rQ9JHX3 529 aa26.78■■□□□ 1.88
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CpdO89001 1377 aa26.78■■□□□ 1.88
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